| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | W3110S.gb | 556,858 | A→T | L36Q (CTG→CAG) | folD ← | bifunctional 5,10‑methylene‑tetrahydrofolate dehydrogenase and 5,10‑methylene‑tetrahydrofolate cyclohydrolase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | W3110S.gb | 556,858 | 0 | A | T | 100.0% | 167.0 / NA | 55 | L36Q (CTG→CAG) | folD | bifunctional 5,10‑methylene‑tetrahydrofolate dehydrogenase and 5,10‑methylene‑tetrahydrofolate cyclohydrolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (24/31); total (24/31) | |||||||||||
GCCTTGCGTTTGCTTGCGACATAAATTTGCGATGCAGGGTTACTA‑CCCACCAGCACAACGGCCAGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGCAATACGCGCCTGAACTTTTTGAGCAACTTCA > W3110S.gb/556795‑556914 | gCCTTGCGTTTGCTTGCGACATAAATTTGCGATGCAGGGTTACTA‑CCCACCAGCACAACGGCCTGTCCTgg > 1:2866512/1‑71 (MQ=255)gCCTTGCGTTTGCTTGCGACATAAATTTGCGATGCAGGGTTACTA‑CCCACCAGCACAACGGCCTGTCCTgg > 1:1401040/1‑71 (MQ=255) cGTTTGCTTGCGACATAAATTTGCGATGCAGGGTTACTA‑CCCACCAGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCg < 1:2473592/71‑1 (MQ=255) cGACATAAATTTGCGATGCAGGGTTACTA‑CCCACCAGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGc < 1:2211595/70‑1 (MQ=255) cGACATAAATTTGCGATGCAGGGTTACTA‑CCCACCAGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGc < 1:563339/70‑1 (MQ=255) aCATATATTTGCGATGCAGGGTTACTA‑CCCACCAGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGc < 1:28085/71‑1 (MQ=255) aCATAAATTTGCGATGCAGGGTTACTA‑CCCACCAGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGc < 1:3511254/71‑1 (MQ=255) aCATAAATTTGCGATGCAGGGTTACTA‑CCCACCAGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGc < 1:198860/71‑1 (MQ=255) aCATAAATTTGCGATGCAGGGTTACTA‑CCCACCAGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGc < 1:3854737/71‑1 (MQ=255) aCATAAATTTGCGATGCAGGGTTACTA‑CCCACCAGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGc < 1:366248/71‑1 (MQ=255) aCATAAATTTGCGATGCAGGGTTACTA‑CCCACCAGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGc < 1:3657579/71‑1 (MQ=255) aTAAATTTGCGATGCAGGGTTACTA‑CCCACCAGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGCaa < 1:292213/71‑1 (MQ=255) aTAAATTTGCGATGCAGGGTTACTA‑CCCACCAGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGCaa < 1:1492075/71‑1 (MQ=255) aTAAATTTGCGATGCAGGGTTACTA‑CCCACCAGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGACCGGCTGCaa < 1:3486244/71‑1 (MQ=255) tAAATTTGCGATGCAGGGTTACTA‑CCCACCAGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGc < 1:1627262/68‑1 (MQ=255) tAAATTTGCGATGCAGGGTTACTA‑CCCACCAGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGc < 1:3702419/68‑1 (MQ=255) tAAATTTGCGATGCAGGGTTACTA‑CCCACCAGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGc < 1:623934/68‑1 (MQ=255) tAAATTTGCGATGCAGGGTTACTA‑CCCACCAGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGCaa < 1:3488242/70‑1 (MQ=255) tAAATTTGCGATGCAGGGTTACTA‑CCCACCAGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGCaa < 1:881151/70‑1 (MQ=255) tAAATTTGCGATGCAGGGTTACTA‑CCCACCAGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGCaa < 1:2527168/70‑1 (MQ=255) tAAATTTGCGATGCAGGGTTACTA‑CCCACCAGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGCaa < 1:1947185/70‑1 (MQ=255) tAAATTTGCGATGCAGGGTTACTA‑CCCACCAGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGCaa < 1:1312506/70‑1 (MQ=255) tAAATTTGCGATGCAGGGTTACTA‑CCCACCAGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGCaa < 1:1307632/70‑1 (MQ=255) aaTTTGCGATGCAGGGTTACTA‑CCCACCAGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGCaa > 1:2642416/1‑68 (MQ=255) aaTTTGCGATGCAGGGTTACTA‑CCCACCAGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGCaa > 1:3984881/1‑68 (MQ=255) aaTTTGCGATGCAGGGTTACTA‑CCCACCAGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGCaa > 1:1561674/1‑68 (MQ=255) gCGATGCAGGGTTACTACCCCACCAGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGCAATAcgcg < 1:1385447/70‑1 (MQ=255) gCGATGCAGGGTTACTACCCCACCAGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGGCCGGCTGCAATAcgcg < 1:1803024/70‑1 (MQ=255) cAGGGTTACTA‑CCCACCAGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGc < 1:441804/55‑1 (MQ=255) ttACTA‑CCCACCAGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGCaa < 1:965020/52‑1 (MQ=255) tacta‑cCCACCAGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGTAGTCCGGCTGCAATACGCGCCTGAACttttt > 1:3015854/1‑69 (MQ=255) tacta‑cCCACCAGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGc < 1:3343443/46‑1 (MQ=255) tacta‑cCCACCAGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGCAATACGCGCCTGAACttttt > 1:4093150/1‑69 (MQ=255) acta‑cCCACCAGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGCAATACGCGCCTGAACTTTTTGAg > 1:1428277/1‑71 (MQ=255) cta‑cCCACCAGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGCAATACGCGCCTGAACTTTTTGAGc < 1:3474920/71‑1 (MQ=255) caccaGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGCAATACGCGCCTGAACTTTTTGAGCAACtt > 1:811647/1‑71 (MQ=255) ccaGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGCAATACGCGCCTGAACTTTTTGAGCa < 1:593081/65‑1 (MQ=255) ccaGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGCAATACGCGCCTGAACTTTTTGAGCa < 1:426033/65‑1 (MQ=255) ccaGCACAACGGCCTGTCCTGGCGCCCGCAGTCCGGCTGCAATACGCGCCTGAACTTTTTGAGCa < 1:510254/65‑1 (MQ=255) caGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGc < 1:736316/39‑1 (MQ=255) aGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCTCAGTCCGGCTGCAATACGCGCCTGAACTTTTTGAGCAAc > 1:1236525/1‑65 (MQ=255) aGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGCAATACGCGCCTGAACTTTTTGAGCAAc > 1:4005636/1‑65 (MQ=255) aGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGCAATACGCGCCTGAACTTTTTGAGCAAc > 1:593650/1‑65 (MQ=255) aGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGCAATACGCGCCTGAACTTTTTGAGCAAc > 1:3759908/1‑65 (MQ=255) aGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGCAATACGCGCCTGAACTTTTTGAGCAAc > 1:371376/1‑65 (MQ=255) aGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGCAATACGCGCCTGAACTTTTTGAGCAAc > 1:3530016/1‑65 (MQ=255) aGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGCAATACGCGCCTGAACTTTTTGAGCAAc > 1:1255347/1‑65 (MQ=255) aGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGCAATACGCGCCTGAACTTTTTGAGCAAc > 1:944408/1‑65 (MQ=255) aGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGCAATACGCGCCTGAACTTTTTGAGCAACTTc > 1:1690556/1‑68 (MQ=255) aGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGCAATACGCGCCTGAACTTTTTGAGCAACTTCa > 1:4092668/1‑69 (MQ=255) aGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGCAATACGCGCCTGAACTTTTTGAGCAACTTCa > 1:1934058/1‑69 (MQ=255) aGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGCAATACGCGCCTGAACTTTTTGAGCAACTTCa > 1:217024/1‑69 (MQ=255) aGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGCAATACGCGCCTGAACTTTTTGAGCAACTTCa > 1:2872308/1‑69 (MQ=255) aGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGCAATACGCGCCTGAACTTTTTGAGCAACTTCa > 1:857628/1‑69 (MQ=255) aGCACAACGGCCTGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGCAATACGCGCCTGAACTTTTTGAGCAACTTCa > 1:3507421/1‑69 (MQ=255) | GCCTTGCGTTTGCTTGCGACATAAATTTGCGATGCAGGGTTACTA‑CCCACCAGCACAACGGCCAGTCCTGGTGCCCGCAGTCCGGCTGCAATACGCGCCTGAACTTTTTGAGCAACTTCA > W3110S.gb/556795‑556914 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |