Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | W3110S.gb | 2,092,365 | A→G | K13E (AAA→GAA) | hisG → | ATP phosphoribosyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | W3110S.gb | 2,092,365 | 0 | A | G | 97.8% | 157.4 / ‑4.0 | 46 | K13E (AAA→GAA) | hisG | ATP phosphoribosyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (31/14); total (32/14) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.76e-01 |
ACAAAATGACAGACAACACTCGTTTACGCATAGCTATGCAGAAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAATTGCTGGCGCGCTGTGGCATTAAAATTAATCTT > W3110S.gb/2092324‑2092430 | aCAAAATGACAGACAACACTCGTTTACGCATAGCTATGCAGaaa > 1:3007409/1‑44 (MQ=255) aCAAAATGACAGACAACACTCGTTTACGCATAGCTATGCAGaaa > 1:1942325/1‑44 (MQ=255) aCAAAATGACAGACAACACTCGTTTACGCATAGCTATGCAGaaa > 1:172754/1‑44 (MQ=255) aCAAAATGACAGACAACACTCGTTTACGCATAGCTATGCAGGAATCCGGCCGTTTa > 1:2709503/1‑56 (MQ=255) aCAAAATGACAGACAACACTCGTTTACGCATAGCTATGCAGGAATCCGGCCGTTTAAGtgatg > 1:1342463/1‑63 (MQ=255) aCAAAATGACAGACAACACTCGTTTACGCATAGCTATGCAGGAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCAcgc > 1:1302555/1‑71 (MQ=255) aCAAAATGACAGACAACACTCGTTTACGCATAGCTATGCAGGAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCAc > 1:1020439/1‑69 (MQ=255) aCAAAATGACAGACAACACTCGTTTACGCATAGCTATGCAGAAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCAcgc > 1:1325620/1‑71 (MQ=255) aCAAAATGACAGACAACACTCGTTTACGCATAGCTATCCAGGAATCCGGCCg > 1:2703716/1‑52 (MQ=255) aTGACAGACAACACTCGTTTACGCATAGCTATGCAGGAATCCGGCCGTTTAAg > 1:2364942/1‑53 (MQ=255) aTGACAGACAACACTCGTTTACGCATAGCTATGCAGGAATCCGGCCGTTTAAGTGATGAc > 1:2166439/1‑60 (MQ=255) aTGACAGACAACACTCGTTTACGCATAGCTATGCAGGAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAAtt > 1:581552/1‑71 (MQ=255) aTGACAGACAACACTCGTTTACGCATAGCTATGCAGGAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAAtt > 1:2447026/1‑71 (MQ=255) aTGACAGACAACACTCGTTTACGCATAGCTATGCAGGAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAAt > 1:2075026/1‑70 (MQ=255) aTGACAGACAACACTCGTTTACGCATAGCTATGCAGGAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAAt > 1:3230494/1‑70 (MQ=255) aTGACAGACAACACTCGTTTACGCATAGCTATGCAGGAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAAt > 1:1114469/1‑70 (MQ=255) caacaCTCGTTTACGCATAGCTATGCAGGAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAATTGCTGgcgc > 1:1116361/1‑71 (MQ=255) acTCGTTTACGCATAGCTATGCAGGAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCa > 1:3969622/1‑51 (MQ=255) acTCGTTTACGCATAGCTATGCAGGAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAATTGCTGGCGCGCtg > 1:409134/1‑71 (MQ=255) acTCGTTTACGCATAGCTATGCAGGAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAATTGCTGGCGCGCtg > 1:3929789/1‑71 (MQ=255) acTCGTTTACGCATAGCTATGCAGGAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAATTGCTGGCGCGCtg > 1:4136607/1‑71 (MQ=255) acTCGTTTACGCATAGCTATGCAGGAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAATTGCTGGCGCGCtg > 1:2415091/1‑71 (MQ=255) acTCGTTTACGCATAGCTATGCAGGAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAATTGCTGGCGCGCtg > 1:3266035/1‑71 (MQ=255) acTCGTTTACGCATAGCTATGCAGGAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAATTGCTGGCGCGCtg > 1:2696424/1‑71 (MQ=255) acTCGTTTACGCATAGCTATGCAGGAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAATTGCTGGCGCGCt > 1:1502579/1‑70 (MQ=255) gTTTACGCATAGCTATGCAGGAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAATTGCTGGCGCGCTGTgg < 1:1257780/70‑1 (MQ=255) gTTTACGCATAGCTATGCAGGAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAATTGCTGGCGAGCTGTgg < 1:3226217/70‑1 (MQ=255) aTAGCTATGCAGGAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAATTGCTGGCGCGCTGTGGCATTAAAAt > 1:2225179/1‑71 (MQ=255) aTAGCTATGCAGGAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAATTGCTGGCGCGCTGTGGCATTAAAAt > 1:2162534/1‑71 (MQ=255) gCTATGCAGGAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAATTGCTGGCGCGCTGTGGc > 1:3861479/1‑60 (MQ=255) gCTATGCAGGAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAATTGCTGGCGCGCTGTGGc > 1:295546/1‑60 (MQ=255) gCTATGCAGGAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAATTGCTGGCGCGCTGTGGCATTAAAATTaa > 1:845574/1‑71 (MQ=255) gCTATGCAGGAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAATTGCTGGCGCGCTGTGGCATTAAAATTa < 1:2435010/70‑1 (MQ=255) gCTATGCAGGAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAATTGCTGGCGCGCTGTGGCATTAAAATTa > 1:2196316/1‑70 (MQ=255) cTATGCAGGAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAATTGCTGGCGCGCTGTGGCATTAAAATTAAt < 1:2460956/71‑1 (MQ=255) cTATGCAGGAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAATTGCTGGCGCGCTGTGGCATTAAAATTAAt < 1:3748265/71‑1 (MQ=255) tGCAGGAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAATTGCTGGCGCGCTGTGGCATTAAAATTAATCtt < 1:313036/71‑1 (MQ=255) tGCAGGAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAATTGCTGGCGCGCTGTGGCATTAAAATTAATCtt < 1:590706/71‑1 (MQ=255) tGCAGGAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAATTGCTGGCGCGCTGTGGCATTAAAATTAATCtt < 1:5297/71‑1 (MQ=255) tGCAGGAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAATTGCTGGCGCGCTGTGGCATTAAAATTAATCtt < 1:489192/71‑1 (MQ=255) tGCAGGAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAATTGCTGGCGCGCTGTGGCATTAAAATTAATCtt < 1:1137290/71‑1 (MQ=255) tGCAGGAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAATTGCTGGCGCGCTGTGGCATTAAAATTAATCtt < 1:4041749/71‑1 (MQ=255) tGCAGGAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAATTGCTGGCGCGCTGTGGCATTAAAATTAATCtt < 1:3992003/71‑1 (MQ=255) tGCAGGAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAATTGCTGGCGCGCTGTGGCATTAAAATTAATCtt < 1:3708381/71‑1 (MQ=255) gCAGGAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAATTGCTGGCGCGCTGTGGCATTAAAATTAATCtt > 1:2130566/1‑70 (MQ=255) gCAGGAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAATTGCTGGCGCGCTGTGGCATTAAAATTAATCtt > 1:1103718/1‑70 (MQ=255) gCAGGAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAATTGCTGGCGCGCTGTGGCATTAAAATTAATCtt > 1:3165635/1‑70 (MQ=255) gCAGGAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAATTGCTGGCGCGCTGTGGCATTAAAATTAATCtt < 1:1008701/70‑1 (MQ=255) gCAGGAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAATTGCTGGCGCGCTGTGGCATTAAAATTAATCt > 1:2317042/1‑69 (MQ=255) | ACAAAATGACAGACAACACTCGTTTACGCATAGCTATGCAGAAATCCGGCCGTTTAAGTGATGACTCACGCGAATTGCTGGCGCGCTGTGGCATTAAAATTAATCTT > W3110S.gb/2092324‑2092430 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |