| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | W3110S.gb | 1,765,363 | +T | coding (361/1488 nt) | sufB ← | component of SufBCD complex |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | W3110S.gb | 1,765,360 | 1 | . | T | 99.0% | 373.1 / ‑3.2 | 101 | coding (364/1488 nt) | sufB | component of SufBCD complex |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/0); new base T (100/0); total (101/0) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.66e-01 | |||||||||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
TGCCTTCCCGCACGGGAACGCCCAACTGCTCAAACGCCGCCTCCACCTC‑TT‑TACTTAAAAAGGC > W3110S.gb/1765312‑1765375 | tGCCTTCCCGCACGGGAACGCCCAACTGCTCAACGGCCGCCTCCACCTCTTT‑TACTTAAAAAGGc > 1:1707208/1‑65 (MQ=255)tGCCTTCCCGCACGGGAACGCCCAACTGCTCAAACGCCGCCTCCTCCTCTTT‑TACTTAAAAAGGc > 1:250984/1‑65 (MQ=255)tGCCTTCCCGCACGGGAACGCCCAACTGCTCAAACGCCGCCTCCCCCTCTTT‑TACTTAAAAAGGc > 1:154789/1‑65 (MQ=255)tGCCTTCCCGCACGGGAACGCCCAACTGCTCAAACGCCGCCTCCACCTCTTT‑TACTTAAAAAGGc > 1:366081/1‑65 (MQ=255)tGCCTTCCCGCACGGGAACGCCCAACTGCTCAAACGCCGCCTCCACCTCTTT‑TACTTAAAAAGGc > 1:532103/1‑65 (MQ=255)tGCCTTCCCGCACGGGAACGCCCAACTGCTCAAACGCCGCCTCCACCTCTTT‑TACTTAAAAAGGc > 1:528812/1‑65 (MQ=255)tGCCTTCCCGCACGGGAACGCCCAACTGCTCAAACGCCGCCTCCACCTCTTT‑TACTTAAAAAGGc > 1:50025/1‑65 (MQ=255)tGCCTTCCCGCACGGGAACGCCCAACTGCTCAAACGCCGCCTCCACCTCTTT‑TACTTAAAAAGGc > 1:461097/1‑65 (MQ=255)tGCCTTCCCGCACGGGAACGCCCAACTGCTCAAACGCCGCCTCCACCTCTTT‑TACTTAAAAAGGc > 1:451895/1‑65 (MQ=255)tGCCTTCCCGCACGGGAACGCCCAACTGCTCAAACGCCGCCTCCACCTCTTT‑TACTTAAAAAGGc > 1:436490/1‑65 (MQ=255)tGCCTTCCCGCACGGGAACGCCCAACTGCTCAAACGCCGCCTCCACCTCTTT‑TACTTAAAAAGGc > 1:42703/1‑65 (MQ=255)tGCCTTCCCGCACGGGAACGCCCAACTGCTCAAACGCCGCCTCCACCTCTTT‑TACTTAAAAAGGc > 1:425507/1‑65 (MQ=255)tGCCTTCCCGCACGGGAACGCCCAACTGCTCAAACGCCGCCTCCACCTCTTT‑TACTTAAAAAGGc > 1:406401/1‑65 (MQ=255)tGCCTTCCCGCACGGGAACGCCCAACTGCTCAAACGCCGCCTCCACCTCTTT‑TACTTAAAAAGGc > 1:399622/1‑65 (MQ=255)tGCCTTCCCGCACGGGAACGCCCAACTGCTCAAACGCCGCCTCCACCTCTTT‑TACTTAAAAAGGc > 1:366091/1‑65 (MQ=255)tGCCTTCCCGCACGGGAACGCCCAACTGCTCAAACGCCGCCTCCACCTCTTT‑TACTTAAAAAGGc > 1:554616/1‑65 (MQ=255)tGCCTTCCCGCACGGGAACGCCCAACTGCTCAAACGCCGCCTCCACCTCTTT‑TACTTAAAAAGGc > 1:35823/1‑65 (MQ=255)tGCCTTCCCGCACGGGAACGCCCAACTGCTCAAACGCCGCCTCCACCTCTTT‑TACTTAAAAAGGc > 1:275677/1‑65 (MQ=255)tGCCTTCCCGCACGGGAACGCCCAACTGCTCAAACGCCGCCTCCACCTCTTT‑TACTTAAAAAGGc > 1:268206/1‑65 (MQ=255)tGCCTTCCCGCACGGGAACGCCCAACTGCTCAAACGCCGCCTCCACCTCTTT‑TACTTAAAAAGGc > 1:265332/1‑65 (MQ=255)tGCCTTCCCGCACGGGAACGCCCAACTGCTCAAACGCCGCCTCCACCTCTTT‑TACTTAAAAAGGc > 1:205629/1‑65 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1:860255/1‑65 (MQ=255)tGCCTTCCCGCACGGGAACGCCCAACTGCTCAAACGCCGCCTCCACCTCTTT‑TACTTAAAAAGGc > 1:85044/1‑65 (MQ=255)tGCCTTCCCGCACGGGAACGCCCAACTGCTCAAACGCCGCCTCCACCTCTTT‑TACTTAAAAAGGc > 1:848850/1‑65 (MQ=255)tGCCTTCCCGCACGGGAACGCCCAACTGCTCAAACGCCGCCTCCACCTCTTT‑TACTTAAAAAGGc > 1:846631/1‑65 (MQ=255)tGCCTTCCCGCACGGGAACGCCCAACTGCTCAAACGCCGCCTCCACCTCTTT‑TACTTAAAAAGGc > 1:83874/1‑65 (MQ=255)tGCCTTCCCGCACGGGAACGCCCAACTGCTCAAACGCCGCCTCCACCTCTTT‑TACTTAAAAAGGc > 1:835423/1‑65 (MQ=255)tGCCTTCCCGCACGGGAACGCCCAACTGCTCAAACGCCGCCTCCACCTCTTT‑TACTTAAAAAGGc > 1:810585/1‑65 (MQ=255)tGCCTTCCCGCACGGGAACGCCCAACTGCTCAAACGCCGCCTCCACCTCTTT‑TACTTAAAAAGGc > 1:1817032/1‑65 (MQ=255)tGCCTTCCCGCACGGGAACGCCCAACTGCTCAAACGCCGCCTCCACCTCTTT‑TACTTAAAAAGGc > 1:760960/1‑65 (MQ=255)tGCCTTCCCGCACGGGAACGCCCAACTGCTCAAACGCCGCCTCCACCTCTTT‑TACTTAAAAAGGc > 1:756715/1‑65 (MQ=255)tGCCTTCCCGCACGGGAACGCCCAACTGCTCAAACGCCGCCTCCACCTCTTT‑TACTTAAAAAGGc > 1:743157/1‑65 (MQ=255)tGCCTTCCCGCACGGGAACGCCCAACTGCTCAAACGCCGCCTCCACCTCTTT‑TACTTAAAAAGGc > 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |