Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 2,485,556 (T)6→7 coding (909/1329 nt) dsdA → D‑serine ammonia‑lyase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb2,485,5501.T76.8% 427.2 / 130.5 151coding (903/1329 nt)dsdAD‑serine ammonia‑lyase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base . (0/35);  new base T (0/116);  total (0/151)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01

Only 100 of 151 total aligned reads displayed.

ATTCGGGCTTAAACTGGCGTTTGGCGATCATGTTCACTGC‑TTTTTTGCCGAACCAACGCACTCCCCTTGTATG  >  W3110S.gb/2485511‑2485583
                                        |                                 
aTTCGGGCTTAAACTGGCGTTTGGCGATCATGTTCACTGC‑TTTTTTGCCGAACCAACGCACTccc          <  1:1182651/65‑1 (MQ=255)
aTTCGGGCTTAAACT‑GCGTTTGGCGATCATGTTCACTGCTTTTTTTGCCGAACCAACGCACTccc          <  1:961737/65‑1 (MQ=255)
 ttCGGGCTTAAACTGGCGTTTGGCGATCATGTTCACTGCTTTTTTTGCCGAACCAACGCACTccc          <  1:728115/65‑1 (MQ=255)
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 ttCGGGCTTAAACTGGCGTTTGGCGATCATGTTCACTGCTTTTTTTGCCGAACCAACGCACTccc          <  1:1795290/65‑1 (MQ=255)
 ttCGGGCTTAAACTGGCGTTTGGCGATCATGTTCACTGCTTTTTTTGCCGAACCAACGCACTccc          <  1:678201/65‑1 (MQ=255)
 ttCGGGCTTAAACTGGCGTTTGGCGATCATGTTCACTGCTTTTTTTGCCGAACCAACGCACTccc          <  1:1782652/65‑1 (MQ=255)
 ttCGGGCTTAAACTGGCGTTTGGCGATCATGTTCACTGCTTTTTTTGCCGAACCAACGCACTccc          <  1:1778390/65‑1 (MQ=255)
 ttCGGGCTTAAACTGGCGTTTGGCGATCATGTTCACTGCTTTTTTTGCCGAACCAACGCACTccc          <  1:174914/65‑1 (MQ=255)
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 ttCGGGCTTAAACTGGCGTTTGGCGATCATGTTCACTGCTTTTTTTGCCGAACCAACGCACTccc          <  1:1692072/65‑1 (MQ=255)
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 ttCGGGCTTAAACTGGCGTTTGGCGATCATGTTCACTGCTTTTTTTGCCGAACCAACGCACTccc          <  1:728759/65‑1 (MQ=255)
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 ttCGGGCTTAAACTGGCGTTTGGCGATCATGTTCACTGCTTTTTTTGCCGAACCAACGCACTccc          <  1:40338/65‑1 (MQ=255)
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 ttCGGGCTTAAACTGGCGTTTGGCGATCATGTTCACTGCTTTTTTTGCCGAACCAACGCACTccc          <  1:559057/65‑1 (MQ=255)
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 ttCGGGCTTAAACTGGCGTTTGGCGATCATGTTCACTGCTTTTTTTGCCGAACCAACGCACTccc          <  1:885234/65‑1 (MQ=255)
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 ttCGGGCTTAAACTGGCGTTTGGCGATCATGTTCACTGCTTTTTTTGCCGAACCAACGCACTccc          <  1:1437569/65‑1 (MQ=255)
 ttCGGGCTTAAACTGGCGTTTGGCGATCATGTTCACTGCTTTTTTTGCCGAACCAACGCACTccc          <  1:143511/65‑1 (MQ=255)
 ttCGGGCTTAAACTGGCGTTTGGCGATCATGTTCACTGCTTTTTTTGCCGAACCAACGCACTccc          <  1:1389731/65‑1 (MQ=255)
 ttCGGGCTTAAACTGGCGTTTGGCGATCATGTTCACTGCTTTTTTTGCCGAACCAACGCACTccc          <  1:819854/65‑1 (MQ=255)
 ttCGGGCTTAAACTGGCGTTTGGCGATCATGTTCACTGCTTTTTTTGCCGAACCAACGCACTccc          <  1:830053/65‑1 (MQ=255)
 ttCGGGCTTAAACTGGCGTTTGGCGATCATGTTCACTGCTTTTTTTGCCGAACCAACGCACTccc          <  1:1359928/65‑1 (MQ=255)
 ttCGGGCTTAAACTGGCGTTTGGCGATCATGTTCACTGCTTTTTTTGCCGAACCAACGCACTccc          <  1:1339690/65‑1 (MQ=255)
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  tCGGGCTTAAACTGGCGTTTGGCGATCATGTTCACTGCTTTTTTTGCCGAACCAACGCACTccc          <  1:1624394/64‑1 (MQ=255)
  tCGGGCTTAAACTGGCGTTTGGCGATCATGTTCACTGCTTTTTTTGCCGAACCAACGCACTccc          <  1:1019215/64‑1 (MQ=255)
  tCGGGCTTAAACTGGCGTTTGGCGATCATGTTCACTGCTTTTTTTGCCGAACCAACGCACTccc          <  1:1363169/64‑1 (MQ=255)
  tCGGGCTTAAACTGGCGTTTGGCGATCATGTTCACTGCTTTTTTTGCCGAACCAACGCACTccc          <  1:1657416/64‑1 (MQ=255)
  tCGGGCTTAAACTGGCGTTTGGCGATCATGTTCACTGCTTTTTTTGCCGAACCAACGCACTccc          <  1:1012378/64‑1 (MQ=255)
     ggCTTAAACTGGCGTTTGGCGATCATGTTCACTGCTTTTTTTGCCGAACCAACGCACTccc          <  1:1288360/61‑1 (MQ=255)
        ttAAACTGGCGTTTGGCGATGATGTTCACTGC‑TTTTTTGCCGAACCAACGCACTCCCCTTGTAtg  <  1:1037496/65‑1 (MQ=255)
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        ttAAACTGGCGTTTGGCGATCATGTTCACTGC‑TTTTTTGCCGAACCAACGCACTCCCCTTGTAtg  <  1:1135246/65‑1 (MQ=255)
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        ttAAACTGGCGTTTGGCGATCATGTTCACTGC‑TTTTTTGCCGAACCAACGCACTCCCCTTGTAtg  <  1:900031/65‑1 (MQ=255)
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        ttAAACTGGCGTTTGGCGATCATGTTCACTGC‑TTTTTTGCCGAACCAACGCACTCCCCTTGTAtg  <  1:146836/65‑1 (MQ=255)
        ttAAACTGGCGTTTGGCGATCATGTTCACTGC‑TTTTTTGCCGAACCAACGCACTCCCCTTGTAtg  <  1:1385362/65‑1 (MQ=255)
        ttAAACTGGCGTTTGGCGATCATGTTCACTGC‑TTTTTTGCCGAACCAACGCACTCCCCTTGTAtg  <  1:323863/65‑1 (MQ=255)
        ttAAACTGGCGTTTGGCGATCATGTTCACTGC‑TTTTTTGCCGAACCAACGCACTCCCCTTGTAtg  <  1:83130/65‑1 (MQ=255)
         tAAACTGGCGTTTGGCGATCATGTTCACTGC‑TTTTTTGCCGAACCAACGCACTCCCCTTGTAtg  <  1:357050/64‑1 (MQ=255)
         tAAACTGGCGTTTGGCGATCATGTTCACTGC‑TTTTTTGCCGAACCAACGCACTCCCCTTGTAtg  <  1:1508241/64‑1 (MQ=255)
            aCTGGCGTTTGGCGATCATGTTCACTGCTTTTTTTGCCGAAGCAACGCTCTccc          <  1:42838/54‑1 (MQ=37)
            aCTGGCGTTTGGCGATCATGTTCACTGCTTTTTTTGCCGAACCAACGCACTccc          <  1:1874368/54‑1 (MQ=255)
                    ttGGCGATCATGTTCACTGC‑TTTTTTGCCGAACCAACGCACTCCCCTTGTAtg  <  1:937321/53‑1 (MQ=255)
                          aTCATGTTCACTGCTTTTTTTGCCGAACCAACGCACTccc          <  1:290907/40‑1 (MQ=38)
                             aTGTTCACTGCTTTTTTTGCCGAACAAACGCACTccc          <  1:186774/37‑1 (MQ=25)
                                        |                                 
ATTCGGGCTTAAACTGGCGTTTGGCGATCATGTTCACTGC‑TTTTTTGCCGAACCAACGCACTCCCCTTGTATG  >  W3110S.gb/2485511‑2485583

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑