Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	3,444,910	+A	coding (98/1134 nt)	thiH →	thiamin biosynthesis ThiGH complex subunit

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	3,444,907	1	.	A	100.0%	210.2 / NA	56	L32Q (CTA→CAA)	thiH	thiamin biosynthesis ThiGH complex subunit
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base . (0/0);  new base A (0/56);  total (0/56)

GTAGAGCGGGCGCT‑AAATGCCTCGCAACTCACCCGCGACGACATGATGGCGCTGTTATCGCC  >  W3110S.gb/3444894‑3444955               |                                                 gTAGAGCGGGCGCTAAAATGCCTCGCAACTCACCCGCGACGACATGATGGCGCTGTTATCGcc  <  1:354377/63‑1 (MQ=255) gTAGAGCGGGCGCTAAAATGCCTCGCAACTCACCCGCGACGACATGATGGCGCTGTTATCGcc  <  1:1017847/63‑1 (MQ=255) gTAGAGCGGGCGCTAAAATGCCTCGCAACTCACCCGCGACGACATGATGGCGCTGTTATCGcc  <  1:1628289/63‑1 (MQ=255) gTAGAGCGGGCGCTAAAATGCCTCGCAACTCACCCGCGACGACATGATGGCGCTGTTATCGcc  <  1:1682035/63‑1 (MQ=255) gTAGAGCGGGCGCTAAAATGCCTCGCAACTCACCCGCGACGACATGATGGCGCTGTTATCGcc  <  1:1742693/63‑1 (MQ=255) gTAGAGCGGGCGCTAAAATGCCTCGCAACTCACCCGCGACGACATGATGGCGCTGTTATCGcc  <  1:1764321/63‑1 (MQ=255) gTAGAGCGGGCGCTAAAATGCCTCGCAACTCACCCGCGACGACATGATGGCGCTGTTATCGcc  <  1:1788997/63‑1 (MQ=255) gTAGAGCGGGCGCTAAAATGCCTCGCAACTCACCCGCGACGACATGATGGCGCTGTTATCGcc  <  1:236165/63‑1 (MQ=255) gTAGAGCGGGCGCTAAAATGCCTCGCAACTCACCCGCGACGACATGATGGCGCTGTTATCGcc  <  1:306336/63‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑