Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	4,460,454	(A)6→7	intergenic (‑163/‑13)	fbp ← / → mpl	fructose‑1,6‑bisphosphatase I/UDP‑N‑acetylmuramate:L‑alanyl‑gamma‑D‑glutamyl‑ meso‑diaminopimelate ligase

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	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	4,460,448	1	.	A	100.0%	262.2 / NA	71	intergenic (‑157/‑19)	fbp/mpl	fructose‑1,6‑bisphosphatase I/UDP‑N‑acetylmuramate:L‑alanyl‑gamma‑D‑glutamyl‑ meso‑diaminopimelate ligase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base . (0/0);  new base A (71/0);  total (71/0)

TAAAATGAGCGGCAGATT‑AAAAAAGGATAGTGACGTATGCGCATTCATATTTTAGGAATTTGT  >  W3110S.gb/4460431‑4460493                   |                                              tAAAATGAGCGGCAGATTAAAAAAAGGATAGTGACGTa                            >  1:292672/1‑38 (MQ=37) tAAAATGAGCGGCAGATTAAAAAAAGGATAGTGACGTATGCGCa                      >  1:516295/1‑44 (MQ=38) tAAAATGAGCGGCAGATTAAAAAAAGGATAGTGACGTATGCGCATTCATATTTTAGGAATTtgt  >  1:289126/1‑64 (MQ=255) tAAAATGAGCGGCAGATTAAAAAAAGGATAGTGACGTATGCGCATTCATATTTTAGGAATTtgt  >  1:429609/1‑64 (MQ=255) tAAAATGAGCGGCAGATTAAAAAAAGGATAGTGACGTATGCGCATTCATATTTTAGGAATTtgt  >  1:419395/1‑64 (MQ=255) tAAAATGAGCGGCAGATTAAAAAAAGGATAGTGACGTATGCGCATTCATATTTTAGGAATTtgt  >  1:400654/1‑64 (MQ=255) tAAAATGAGCGGCAGATTAAAAAAAGGATAGTGACGTATGCGCATTCATATTTTAGGAATTtgt  >  1:360549/1‑64 (MQ=255) tAAAATGAGCGGCAGATTAAAAAAAGGATAGTGACGTATGCGCATTCATATTTTAGGAATTtgt  >  1:358987/1‑64 (MQ=255) tAAAATGAGCGGCAGATTAAAAAAAGGATAGTGACGTATGCGCATTCATATTTTAGGAATTtgt  >  1:351257/1‑64 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑