Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2626043	2626069	27	77 [0]	[0] 80	yfgF	predicted inner membrane protein

GATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAC  >  W3110S.gb/2625978‑2626042                                                                 | gatcagatcaTCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:159269/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:350101/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:50352/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:457603/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:451698/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:429658/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:429317/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:393884/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:375838/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:370637/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:539472/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:343549/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:321993/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:282176/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:269882/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:256845/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:245270/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:237634/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:1884843/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:740322/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:956851/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:893179/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:878709/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:850123/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:785419/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:765372/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:763272/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:748441/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:221619/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:735777/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:694185/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:681900/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:642379/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:623387/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:595128/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:583885/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:544835/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:1337309/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:187877/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:1506028/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:1491070/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:1480732/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:1480303/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:1478140/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:1385302/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:1375500/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:1346115/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:1506543/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:1276964/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:1206938/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:1166417/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:1159806/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:1159069/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:1118042/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:1116696/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:1066028/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:1507367/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:1520884/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:1539699/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:1565476/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:1581747/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:1601349/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:1825970/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:1608922/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:1814015/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:1685417/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:1732213/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:1741440/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:1795591/65‑1 (MQ=255) gATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:1811995/65‑1 (MQ=255) gATCAGTGCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGATGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:1013499/65‑1 (MQ=255) gATCAGCTAATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:943765/65‑1 (MQ=255)  aTCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:261102/64‑1 (MQ=255)  aTCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:1629195/64‑1 (MQ=255)  aTCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:1605788/64‑1 (MQ=255)                          aTGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:463926/40‑1 (MQ=255)                              gcAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAc  <  1:934977/36‑1 (MQ=255)                                                                 | GATCAGTTCATCATTCTCACCTTTCATGCGCAGAAGAATTTCATGGTAAACATCACCACGCATAC  >  W3110S.gb/2625978‑2626042

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑