Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2667178	2667479	302	54 [0]	[0] 13	hcaR	DNA‑binding transcriptional regulator

TGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAA  >  W3110S.gb/2667113‑2667177                                                                 | tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:59851/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:1040813/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:237815/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:289237/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:339242/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:414269/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:475555/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:477149/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:483518/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:485174/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:486071/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:493062/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:526277/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:559829/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:235717/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:621993/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:637072/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:659951/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:717631/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:742973/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:745945/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:751724/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:758145/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:773658/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:805100/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:833319/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:956444/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:1441342/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:1083905/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:1202111/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:1227640/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:1235304/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:1317438/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:135343/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:1357319/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:1375092/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:1385629/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:1434628/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:234797/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:1533571/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:163471/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:166981/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:1717348/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:1767300/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:1775979/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:1794574/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:1798459/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:1799200/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:19424/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:199798/65‑1 (MQ=255) tGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGGGGTGATTaa  <  1:1141755/65‑1 (MQ=255)     gcATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:1720370/61‑1 (MQ=255)        ttAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:1186025/58‑1 (MQ=255)              cGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTaa  <  1:910709/52‑1 (MQ=255)                                                                 | TGGCGCATTAAGCCGACGTCGAGTTCACCACGGCGAATTTTTTCCTCCTGTTGCGTGGTGATTAA  >  W3110S.gb/2667113‑2667177

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑