Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2678752	2678897	146	26 [0]	[0] 13	yphG	conserved hypothetical protein

TGGCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCC  >  W3110S.gb/2678689‑2678751                                                               | tGGCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAATCTGACTGGTGAccttcc  <  1:123947/63‑1 (MQ=255) tGGCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGAccttcc  <  1:246009/63‑1 (MQ=255) tGGCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGAccttcc  <  1:99775/63‑1 (MQ=255) tGGCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGAccttcc  <  1:956408/63‑1 (MQ=255) tGGCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGAccttcc  <  1:907073/63‑1 (MQ=255) tGGCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGAccttcc  <  1:905776/63‑1 (MQ=255) tGGCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGAccttcc  <  1:823433/63‑1 (MQ=255) tGGCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGAccttcc  <  1:811674/63‑1 (MQ=255) tGGCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGAccttcc  <  1:79177/63‑1 (MQ=255) tGGCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGAccttcc  <  1:695448/63‑1 (MQ=255) tGGCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGAccttcc  <  1:653289/63‑1 (MQ=255) tGGCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGAccttcc  <  1:64002/63‑1 (MQ=255) tGGCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGAccttcc  <  1:1041083/63‑1 (MQ=255) tGGCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGAccttcc  <  1:1709905/63‑1 (MQ=255) tGGCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGAccttcc  <  1:1598409/63‑1 (MQ=255) tGGCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGAccttcc  <  1:1459753/63‑1 (MQ=255) tGGCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGAccttcc  <  1:1448177/63‑1 (MQ=255) tGGCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGAccttcc  <  1:1400561/63‑1 (MQ=255) tGGCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGAccttcc  <  1:1372718/63‑1 (MQ=255) tGGCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGAccttcc  <  1:1322446/63‑1 (MQ=255) tGGCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGAccttcc  <  1:1215402/63‑1 (MQ=255) tGGCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGAccttcc  <  1:1198738/63‑1 (MQ=255) tGGCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGAccttcc  <  1:1041682/63‑1 (MQ=255) tGGCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGGTGAGGATAAACTGACTGGTGAccttcc  <  1:693181/63‑1 (MQ=255)              ctgcCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGAccttcc  <  1:817152/50‑1 (MQ=255)                 ccAGGCGCGTAATAACTGGGTGAGGATAAACTGACTGGTGAccttcc  <  1:1139191/47‑1 (MQ=255)                                                               | TGGCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCC  >  W3110S.gb/2678689‑2678751

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑