Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 2679980 2680215 236 164 [0] [0] 65 yphG conserved hypothetical protein

Only 100 of 164 total aligned reads displayed.

CGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGTG  >  W3110S.gb/2679915‑2679979
                                                                |
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTCGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1728962/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:276817/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:512920/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:499987/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:495385/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:45422/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:43930/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:436502/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:427397/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:410268/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:333558/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:314494/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:310745/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:51377/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:258056/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:22832/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:208826/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:207736/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1870528/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1008475/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:185114/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1815778/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1812489/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:763005/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:973133/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:951234/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:936598/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:921156/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:89970/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:893848/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:88738/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:833783/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:822827/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:802306/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:794279/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1864578/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:755619/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:742821/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:724344/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:722616/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:71580/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:700867/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:690419/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:652217/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:549902/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:525997/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1316573/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1426980/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1423734/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1771710/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1411014/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:140153/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1390553/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1377451/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1367285/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1364798/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1354752/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1339240/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1412489/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:127474/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1274689/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1258512/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1209106/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1195035/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1122499/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1102351/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1098894/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1059288/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1053669/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1019090/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1574334/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1746028/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1732538/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1695461/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1677054/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1666763/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1656716/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1638544/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:163312/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1594710/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1432916/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1567584/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1547691/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1532052/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1517459/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1499577/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1466928/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1459403/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGCGAACGGCTGGCGtg  <  1:262016/65‑1 (MQ=255)
cGATAATCCAGCGGGTCCAGCACCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1302835/65‑1 (MQ=255)
 gATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:459432/64‑1 (MQ=255)
 gATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:626776/64‑1 (MQ=255)
 gATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:603794/64‑1 (MQ=255)
 gATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:169179/64‑1 (MQ=255)
 gATAATCCAGCAGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:388950/64‑1 (MQ=255)
  aTAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:857035/63‑1 (MQ=255)
      tCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:583443/59‑1 (MQ=255)
              gTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:1208685/51‑1 (MQ=255)
                 cAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:421968/48‑1 (MQ=255)
                           ccgcGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGtg  <  1:470209/38‑1 (MQ=255)
                                                                |
CGATAATCCAGCGGGTCCAGCGCCACGCCGCGCAGGTAGTAATCGAACGGTGAACGGCTGGCGTG  >  W3110S.gb/2679915‑2679979

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: