Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2696721	2696723	3	28 [0]	[0] 56	yfhB	conserved hypothetical protein

TCGCTATAGCCACTGTACAGCCGCAGCGGAGTGCCGATTTTGCGCTCCAGTTGTGCGACCTTTTC  >  W3110S.gb/2696656‑2696720                                                                 | tCGCTATAGCCACTGTACAGCCGCAGCGGAGTGCCGATTTTGCGCTCCAGTTGTGCGACCTTTTc  >  1:428104/1‑65 (MQ=255) tCGCTATAGCCACTGTACAGCCGCAGCGGAGTGCCGATTTTGCGCTCCAGTTGTGCGACCTTTTc  >  1:981331/1‑65 (MQ=255) tCGCTATAGCCACTGTACAGCCGCAGCGGAGTGCCGATTTTGCGCTCCAGTTGTGCGACCTTTTc  >  1:900739/1‑65 (MQ=255) tCGCTATAGCCACTGTACAGCCGCAGCGGAGTGCCGATTTTGCGCTCCAGTTGTGCGACCTTTTc  >  1:860978/1‑65 (MQ=255) tCGCTATAGCCACTGTACAGCCGCAGCGGAGTGCCGATTTTGCGCTCCAGTTGTGCGACCTTTTc  >  1:820857/1‑65 (MQ=255) tCGCTATAGCCACTGTACAGCCGCAGCGGAGTGCCGATTTTGCGCTCCAGTTGTGCGACCTTTTc  >  1:815838/1‑65 (MQ=255) tCGCTATAGCCACTGTACAGCCGCAGCGGAGTGCCGATTTTGCGCTCCAGTTGTGCGACCTTTTc  >  1:803589/1‑65 (MQ=255) tCGCTATAGCCACTGTACAGCCGCAGCGGAGTGCCGATTTTGCGCTCCAGTTGTGCGACCTTTTc  >  1:797412/1‑65 (MQ=255) tCGCTATAGCCACTGTACAGCCGCAGCGGAGTGCCGATTTTGCGCTCCAGTTGTGCGACCTTTTc  >  1:77080/1‑65 (MQ=255) tCGCTATAGCCACTGTACAGCCGCAGCGGAGTGCCGATTTTGCGCTCCAGTTGTGCGACCTTTTc  >  1:676586/1‑65 (MQ=255) tCGCTATAGCCACTGTACAGCCGCAGCGGAGTGCCGATTTTGCGCTCCAGTTGTGCGACCTTTTc  >  1:575825/1‑65 (MQ=255) tCGCTATAGCCACTGTACAGCCGCAGCGGAGTGCCGATTTTGCGCTCCAGTTGTGCGACCTTTTc  >  1:565796/1‑65 (MQ=255) tCGCTATAGCCACTGTACAGCCGCAGCGGAGTGCCGATTTTGCGCTCCAGTTGTGCGACCTTTTc  >  1:516789/1‑65 (MQ=255) tCGCTATAGCCACTGTACAGCCGCAGCGGAGTGCCGATTTTGCGCTCCAGTTGTGCGACCTTTTc  >  1:476376/1‑65 (MQ=255) tCGCTATAGCCACTGTACAGCCGCAGCGGAGTGCCGATTTTGCGCTCCAGTTGTGCGACCTTTTc  >  1:1139250/1‑65 (MQ=255) tCGCTATAGCCACTGTACAGCCGCAGCGGAGTGCCGATTTTGCGCTCCAGTTGTGCGACCTTTTc  >  1:383853/1‑65 (MQ=255) tCGCTATAGCCACTGTACAGCCGCAGCGGAGTGCCGATTTTGCGCTCCAGTTGTGCGACCTTTTc  >  1:370876/1‑65 (MQ=255) tCGCTATAGCCACTGTACAGCCGCAGCGGAGTGCCGATTTTGCGCTCCAGTTGTGCGACCTTTTc  >  1:333105/1‑65 (MQ=255) tCGCTATAGCCACTGTACAGCCGCAGCGGAGTGCCGATTTTGCGCTCCAGTTGTGCGACCTTTTc  >  1:1821210/1‑65 (MQ=255) tCGCTATAGCCACTGTACAGCCGCAGCGGAGTGCCGATTTTGCGCTCCAGTTGTGCGACCTTTTc  >  1:1780501/1‑65 (MQ=255) tCGCTATAGCCACTGTACAGCCGCAGCGGAGTGCCGATTTTGCGCTCCAGTTGTGCGACCTTTTc  >  1:1547590/1‑65 (MQ=255) tCGCTATAGCCACTGTACAGCCGCAGCGGAGTGCCGATTTTGCGCTCCAGTTGTGCGACCTTTTc  >  1:14980/1‑65 (MQ=255) tCGCTATAGCCACTGTACAGCCGCAGCGGAGTGCCGATTTTGCGCTCCAGTTGTGCGACCTTTTc  >  1:1429958/1‑65 (MQ=255) tCGCTATAGCCACTGTACAGCCGCAGCGGAGTGCCGATTTTGCGCTCCAGTTGTGCGACCTTTTc  >  1:1405240/1‑65 (MQ=255) tCGCTATAGCCACTGTACAGCCGCAGCGGAGTGCCGATTTTGCGCTCCAGTTGTGCGACCTTTTc  >  1:1367957/1‑65 (MQ=255) tCGCTATAGCCACTGTACAGCCGCAGCGGAGTGCCGATTTTGCGCTCCAGTTGTGCGACCTTTTc  >  1:1276106/1‑65 (MQ=255) tCGCTATAGCCACTGTACAGCCGCAGCGGAGTGCCGATTTTGCGCTCCAGTTGTGCGACCTTTTc  >  1:1180127/1‑65 (MQ=255) tCGCTATAGCCACTCTACAGCCGCAGCGCAGTGCCGATTTTGCGCTCCAGTTGTGCGACCTTTTc  >  1:1596581/1‑65 (MQ=255)                                                                 | TCGCTATAGCCACTGTACAGCCGCAGCGGAGTGCCGATTTTGCGCTCCAGTTGTGCGACCTTTTC  >  W3110S.gb/2696656‑2696720

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑