Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 2707645 2707717 73 126 [0] [0] 24 rseA anti‑sigma factor

Only 100 of 126 total aligned reads displayed.

CATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGC  >  W3110S.gb/2707580‑2707644
                                                                |
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTGCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:1561463/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:285229/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:45527/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:445347/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:409487/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:399001/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:398792/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:382243/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:316821/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:309582/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:287805/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:468899/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:268634/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:264264/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:245157/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:244313/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:218808/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:217352/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:1000956/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:1860131/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:1821555/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:18061/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:709450/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:985815/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:981609/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:978370/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:954996/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:944072/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:815357/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:769091/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:73018/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:70970/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:709678/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:188600/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:648483/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:611226/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:609126/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:579483/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:530275/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:521255/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:515244/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:506578/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:472604/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:469736/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:1267096/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:1525825/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:1517260/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:1455996/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:1427371/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:1421500/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:1352596/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:132225/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:131632/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:1314282/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:1299287/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:178587/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:1247871/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:1176971/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:116234/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:1125995/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:1117347/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:1089186/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:1087267/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:1055771/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:1036951/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:1551608/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:1796479/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:1740257/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:1738745/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:173415/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:1715760/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:1683134/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:167376/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:1671305/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:1640556/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:1533629/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:1620708/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:1560821/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:1553389/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:1626553/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTCACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:1729132/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGGCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:1286770/65‑1 (MQ=255)
cATTGTTTGCGGGCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:430721/65‑1 (MQ=255)
 aTTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:1190688/64‑1 (MQ=255)
 aTTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:103278/64‑1 (MQ=255)
 aTTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:429787/64‑1 (MQ=255)
 aTTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:18576/64‑1 (MQ=255)
 aTTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:1867046/64‑1 (MQ=255)
 aTTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:815134/64‑1 (MQ=255)
 aTTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:772298/64‑1 (MQ=255)
 aTTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:583119/64‑1 (MQ=255)
  ttGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:683036/63‑1 (MQ=255)
    gTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:1409331/61‑1 (MQ=255)
                 tCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:1645620/48‑1 (MQ=255)
                   aGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGTCTTTACCCATCATCGGc  <  1:196420/46‑1 (MQ=255)
                      aGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:386125/43‑1 (MQ=255)
                      aGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:676349/43‑1 (MQ=255)
                       ggTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:79068/42‑1 (MQ=255)
                           cTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:1208063/38‑1 (MQ=255)
                           cTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGc  <  1:555307/38‑1 (MQ=255)
                                                                |
CATTGTTTGCGGTCGCTTCAGAAGGTACTCCCAGGCTTACCGGGCTGGCTTTACCCATCATCGGC  >  W3110S.gb/2707580‑2707644

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑