Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2728248	2730019	1772	39 [0]	[0] 45	rrsG	rrsG

TTCAGCCTCACTCCCAACGCGTAAACGCCTTGCTATTCACTTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGC  >  W3110S.gb/2728183‑2728247                                                                 | ttCAGCCTCACTCCCAACGCGTAAACGCCTTGCTATTCACTTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGc  >  1:517592/1‑65 (MQ=255) ttCAGCCTCACTCCCAACGCGTAAACGCCTTGCTATTCACTTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGc  >  1:1876070/1‑65 (MQ=255) ttCAGCCTCACTCCCAACGCGTAAACGCCTTGCTATTCACTTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGc  >  1:187620/1‑65 (MQ=255) ttCAGCCTCACTCCCAACGCGTAAACGCCTTGCTATTCACTTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGc  >  1:237394/1‑65 (MQ=255) ttCAGCCTCACTCCCAACGCGTAAACGCCTTGCTATTCACTTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGc  >  1:274000/1‑65 (MQ=255) ttCAGCCTCACTCCCAACGCGTAAACGCCTTGCTATTCACTTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGc  >  1:284877/1‑65 (MQ=255) ttCAGCCTCACTCCCAACGCGTAAACGCCTTGCTATTCACTTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGc  >  1:306248/1‑65 (MQ=255) ttCAGCCTCACTCCCAACGCGTAAACGCCTTGCTATTCACTTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGc  >  1:373942/1‑65 (MQ=255) ttCAGCCTCACTCCCAACGCGTAAACGCCTTGCTATTCACTTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGc  >  1:426862/1‑65 (MQ=255) ttCAGCCTCACTCCCAACGCGTAAACGCCTTGCTATTCACTTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGc  >  1:485240/1‑65 (MQ=255) ttCAGCCTCACTCCCAACGCGTAAACGCCTTGCTATTCACTTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGc  >  1:1815860/1‑65 (MQ=255) ttCAGCCTCACTCCCAACGCGTAAACGCCTTGCTATTCACTTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGc  >  1:568593/1‑65 (MQ=255) ttCAGCCTCACTCCCAACGCGTAAACGCCTTGCTATTCACTTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGc  >  1:647939/1‑65 (MQ=255) ttCAGCCTCACTCCCAACGCGTAAACGCCTTGCTATTCACTTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGc  >  1:664408/1‑65 (MQ=255) ttCAGCCTCACTCCCAACGCGTAAACGCCTTGCTATTCACTTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGc  >  1:757108/1‑65 (MQ=255) ttCAGCCTCACTCCCAACGCGTAAACGCCTTGCTATTCACTTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGc  >  1:821197/1‑65 (MQ=255) ttCAGCCTCACTCCCAACGCGTAAACGCCTTGCTATTCACTTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGc  >  1:830333/1‑65 (MQ=255) ttCAGCCTCACTCCCAACGCGTAAACGCCTTGCTATTCACTTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGc  >  1:840712/1‑65 (MQ=255) ttCAGCCTCACTCCCAACGCGTAAACGCCTTGCTATTCACTTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGc  >  1:902371/1‑65 (MQ=255) ttCAGCCTCACTCCCAACGCGTAAACGCCTTGCTATTCACTTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGc  >  1:948770/1‑65 (MQ=255) ttCAGCCTCACTCCCAACGCGTAAACGCCTTGCTATTCACTTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGc  >  1:1397308/1‑65 (MQ=255) ttCAGCCTCACTCCCAACGCGTAAACGCCTTGCTATTCACTTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGc  >  1:103412/1‑65 (MQ=255) ttCAGCCTCACTCCCAACGCGTAAACGCCTTGCTATTCACTTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGc  >  1:1043468/1‑65 (MQ=255) ttCAGCCTCACTCCCAACGCGTAAACGCCTTGCTATTCACTTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGc  >  1:1116183/1‑65 (MQ=255) ttCAGCCTCACTCCCAACGCGTAAACGCCTTGCTATTCACTTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGc  >  1:1198957/1‑65 (MQ=255) ttCAGCCTCACTCCCAACGCGTAAACGCCTTGCTATTCACTTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGc  >  1:1228376/1‑65 (MQ=255) ttCAGCCTCACTCCCAACGCGTAAACGCCTTGCTATTCACTTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGc  >  1:1319685/1‑65 (MQ=255) ttCAGCCTCACTCCCAACGCGTAAACGCCTTGCTATTCACTTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGc  >  1:1325687/1‑65 (MQ=255) ttCAGCCTCACTCCCAACGCGTAAACGCCTTGCTATTCACTTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGc  >  1:1331788/1‑65 (MQ=255) ttCAGCCTCACTCCCAACGCGTAAACGCCTTGCTATTCACTTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGc  >  1:1364407/1‑65 (MQ=255) ttCAGCCTCACTCCCAACGCGTAAACGCCTTGCTATTCACTTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGc  >  1:1012932/1‑65 (MQ=255) ttCAGCCTCACTCCCAACGCGTAAACGCCTTGCTATTCACTTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGc  >  1:1427697/1‑65 (MQ=255) ttCAGCCTCACTCCCAACGCGTAAACGCCTTGCTATTCACTTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGc  >  1:1446497/1‑65 (MQ=255) ttCAGCCTCACTCCCAACGCGTAAACGCCTTGCTATTCACTTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGc  >  1:1598468/1‑65 (MQ=255) ttCAGCCTCACTCCCAACGCGTAAACGCCTTGCTATTCACTTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGc  >  1:167556/1‑65 (MQ=255) ttCAGCCTCACTCCCAACGCGTAAACGCCTTGCTATTCACTTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGc  >  1:1682108/1‑65 (MQ=255) ttCAGCCTCACTCCCAACGCGTAAACGCCTTGCTATTCACTTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGc  >  1:1702076/1‑65 (MQ=255) ttCAGCCTCACTCCCAACGCGTAAACGCCTTGCTATTCACTTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGc  >  1:1760402/1‑65 (MQ=255) ttCAGCCTCACTCCCAACGCGTAAACGCCTTGCTATTCACTTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGc  >  1:1779476/1‑65 (MQ=255)                                                                 | TTCAGCCTCACTCCCAACGCGTAAACGCCTTGCTATTCACTTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGC  >  W3110S.gb/2728183‑2728247

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑