Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2743525	2743698	174	63 [0]	[0] 12	trmD	tRNA (guanine‑1‑)‑methyltransferase

GGGCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTCC  >  W3110S.gb/2743460‑2743524                                                                 | gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTGCCAGTACTcc  >  1:42650/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:618437/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:313219/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:32498/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:33956/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:369977/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:37770/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:385976/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:433887/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:457714/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:478616/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:496941/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:503289/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:533532/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:603464/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:615722/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:309431/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:653641/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:658824/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:661706/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:712776/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:717303/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:745537/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:759753/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:776403/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:824244/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:839772/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:85642/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:920827/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:927378/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:954288/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:961193/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:1453684/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:1057548/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:1065349/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:1077451/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:1114475/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:1155004/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:1174681/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:121611/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:1277674/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:1338028/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:1352491/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:1359836/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:137886/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:1406879/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:102958/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:1493513/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:1642184/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:1689104/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:17131/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:173053/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:1756320/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:176053/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:1789755/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:179832/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:182242/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:235138/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:276044/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:308065/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCACAGTACTcc  >  1:1570504/1‑65 (MQ=255) gggCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCACAGTACTcc  >  1:1312719/1‑65 (MQ=255) gggCAATACAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTcc  >  1:1152702/1‑65 (MQ=255)                                                                 | GGGCAATCCAGCAATCCTTCAGCAAAGGAATCTTCCGTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTCC  >  W3110S.gb/2743460‑2743524

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑