Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2748549	2748651	103	54 [0]	[0] 73	yfjD	predicted inner membrane protein

ATGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGCC  >  W3110S.gb/2748484‑2748548                                                                 | aTGGCACCGCCAACGTGTGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:1866507/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:538173/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:1857489/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:1861125/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:207360/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:262921/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:301072/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:323029/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:35819/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:367204/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:445684/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:487947/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:499318/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:518550/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:1836878/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:576351/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:68581/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:68901/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:710084/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:773831/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:839511/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:867847/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:922333/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:922858/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:943751/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:957320/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:987695/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:1387621/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:107538/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:1083943/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:1113673/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:1130775/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:1152941/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:1158728/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:1190541/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:1207085/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:1211118/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:1223807/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:1247299/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:1348581/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:1374149/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:1022935/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:1393460/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:1461266/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:1474410/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:1483631/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:1542146/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:1556210/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:1586458/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:1643827/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:1664124/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:170126/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:170477/1‑65 (MQ=255) aTGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGcc  >  1:1728848/1‑65 (MQ=255)                                                                 | ATGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCCTTTAACTGGCATCTACCGGAAGATGATGCC  >  W3110S.gb/2748484‑2748548

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑