Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2754793	2755008	216	85 [0]	[0] 39	[intA]	[intA]

AATTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTGGG  >  W3110S.gb/2754728‑2754792                                                                 | aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:454896/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:625906/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:623737/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:613495/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:610337/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:603365/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:603008/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:544512/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:481720/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:473929/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:652577/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:440021/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:322754/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:310568/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:285866/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:243676/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:1785614/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:1748194/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:1731438/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:841671/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:987926/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:987808/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:970038/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:952152/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:918626/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:862464/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:859914/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:850721/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:23242/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:802302/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:797805/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:795448/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:785471/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:776361/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:760274/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:720548/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:666296/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:1271381/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:1443532/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:1425636/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:1376893/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:1359701/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:1330601/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:1296707/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:1287642/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:1284784/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:1278275/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:1277303/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:1718053/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:1234737/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:1206336/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:1161011/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:113221/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:1116505/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:1115161/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:111241/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:1058505/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:1053031/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:1507810/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:1730546/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:1708489/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:1682023/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:1679553/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:165447/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:1603481/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:1593270/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:1570221/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:1492524/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:1557713/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:1554469/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:1541193/65‑1 (MQ=255) aaTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:1510475/65‑1 (MQ=255)  aTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:77347/64‑1 (MQ=255)  aTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:573755/64‑1 (MQ=255)  aTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:140717/64‑1 (MQ=255)  aTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:1858356/64‑1 (MQ=255)  aTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:906072/64‑1 (MQ=255)  aTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:1116627/64‑1 (MQ=255)  aTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:277152/64‑1 (MQ=255)  aTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:286587/64‑1 (MQ=255)  aTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:29309/64‑1 (MQ=255)  aTTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:751582/64‑1 (MQ=255)        tCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:259287/58‑1 (MQ=255)         ccGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:1051400/57‑1 (MQ=255)                  ttAGGCCCATTGATAGGCCCTACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTggg  <  1:798619/48‑1 (MQ=255)                                                                 | AATTAAATCCGAACCTTTTAGGCCCATTGATAGGCCCAACGAAAAGCTCTATTGTTTACGTTGGG  >  W3110S.gb/2754728‑2754792

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑