Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2755199	2755285	87	41 [0]	[0] 118	intA	integrase

CTTGTTAGTTGCCGAGCGTTGGTGGAATGTGAAGAAAACCAGCGTAACAGAGGACTATGCCGAC  >  W3110S.gb/2755135‑2755198                                                                | cttGTTAGTTGCCGAGCGTTGGTGGAATGTGAAGAAAACCGGCGTAACAGAGGACTATGCcgac  >  1:1817558/1‑64 (MQ=255) cttGTTAGTTGCCGAGCGTTGGTGGAATGTGAAGAAAACCAGCGTAACAGAGGACTATGCcgac  >  1:542609/1‑64 (MQ=255) cttGTTAGTTGCCGAGCGTTGGTGGAATGTGAAGAAAACCAGCGTAACAGAGGACTATGCcgac  >  1:1838777/1‑64 (MQ=255) cttGTTAGTTGCCGAGCGTTGGTGGAATGTGAAGAAAACCAGCGTAACAGAGGACTATGCcgac  >  1:1858660/1‑64 (MQ=255) cttGTTAGTTGCCGAGCGTTGGTGGAATGTGAAGAAAACCAGCGTAACAGAGGACTATGCcgac  >  1:199541/1‑64 (MQ=255) cttGTTAGTTGCCGAGCGTTGGTGGAATGTGAAGAAAACCAGCGTAACAGAGGACTATGCcgac  >  1:203306/1‑64 (MQ=255) cttGTTAGTTGCCGAGCGTTGGTGGAATGTGAAGAAAACCAGCGTAACAGAGGACTATGCcgac  >  1:344924/1‑64 (MQ=255) cttGTTAGTTGCCGAGCGTTGGTGGAATGTGAAGAAAACCAGCGTAACAGAGGACTATGCcgac  >  1:388398/1‑64 (MQ=255) cttGTTAGTTGCCGAGCGTTGGTGGAATGTGAAGAAAACCAGCGTAACAGAGGACTATGCcgac  >  1:412056/1‑64 (MQ=255) cttGTTAGTTGCCGAGCGTTGGTGGAATGTGAAGAAAACCAGCGTAACAGAGGACTATGCcgac  >  1:459256/1‑64 (MQ=255) cttGTTAGTTGCCGAGCGTTGGTGGAATGTGAAGAAAACCAGCGTAACAGAGGACTATGCcgac  >  1:542323/1‑64 (MQ=255) cttGTTAGTTGCCGAGCGTTGGTGGAATGTGAAGAAAACCAGCGTAACAGAGGACTATGCcgac  >  1:1779795/1‑64 (MQ=255) cttGTTAGTTGCCGAGCGTTGGTGGAATGTGAAGAAAACCAGCGTAACAGAGGACTATGCcgac  >  1:591673/1‑64 (MQ=255) cttGTTAGTTGCCGAGCGTTGGTGGAATGTGAAGAAAACCAGCGTAACAGAGGACTATGCcgac  >  1:595684/1‑64 (MQ=255) cttGTTAGTTGCCGAGCGTTGGTGGAATGTGAAGAAAACCAGCGTAACAGAGGACTATGCcgac  >  1:596022/1‑64 (MQ=255) cttGTTAGTTGCCGAGCGTTGGTGGAATGTGAAGAAAACCAGCGTAACAGAGGACTATGCcgac  >  1:687634/1‑64 (MQ=255) cttGTTAGTTGCCGAGCGTTGGTGGAATGTGAAGAAAACCAGCGTAACAGAGGACTATGCcgac  >  1:700661/1‑64 (MQ=255) cttGTTAGTTGCCGAGCGTTGGTGGAATGTGAAGAAAACCAGCGTAACAGAGGACTATGCcgac  >  1:76948/1‑64 (MQ=255) cttGTTAGTTGCCGAGCGTTGGTGGAATGTGAAGAAAACCAGCGTAACAGAGGACTATGCcgac  >  1:854770/1‑64 (MQ=255) cttGTTAGTTGCCGAGCGTTGGTGGAATGTGAAGAAAACCAGCGTAACAGAGGACTATGCcgac  >  1:931094/1‑64 (MQ=255) cttGTTAGTTGCCGAGCGTTGGTGGAATGTGAAGAAAACCAGCGTAACAGAGGACTATGCcgac  >  1:976487/1‑64 (MQ=255) cttGTTAGTTGCCGAGCGTTGGTGGAATGTGAAGAAAACCAGCGTAACAGAGGACTATGCcgac  >  1:1455273/1‑64 (MQ=255) cttGTTAGTTGCCGAGCGTTGGTGGAATGTGAAGAAAACCAGCGTAACAGAGGACTATGCcgac  >  1:1159770/1‑64 (MQ=255) cttGTTAGTTGCCGAGCGTTGGTGGAATGTGAAGAAAACCAGCGTAACAGAGGACTATGCcgac  >  1:1164951/1‑64 (MQ=255) cttGTTAGTTGCCGAGCGTTGGTGGAATGTGAAGAAAACCAGCGTAACAGAGGACTATGCcgac  >  1:1165665/1‑64 (MQ=255) cttGTTAGTTGCCGAGCGTTGGTGGAATGTGAAGAAAACCAGCGTAACAGAGGACTATGCcgac  >  1:1169692/1‑64 (MQ=255) cttGTTAGTTGCCGAGCGTTGGTGGAATGTGAAGAAAACCAGCGTAACAGAGGACTATGCcgac  >  1:1217729/1‑64 (MQ=255) cttGTTAGTTGCCGAGCGTTGGTGGAATGTGAAGAAAACCAGCGTAACAGAGGACTATGCcgac  >  1:1236632/1‑64 (MQ=255) cttGTTAGTTGCCGAGCGTTGGTGGAATGTGAAGAAAACCAGCGTAACAGAGGACTATGCcgac  >  1:1249438/1‑64 (MQ=255) cttGTTAGTTGCCGAGCGTTGGTGGAATGTGAAGAAAACCAGCGTAACAGAGGACTATGCcgac  >  1:1318198/1‑64 (MQ=255) cttGTTAGTTGCCGAGCGTTGGTGGAATGTGAAGAAAACCAGCGTAACAGAGGACTATGCcgac  >  1:1321529/1‑64 (MQ=255) cttGTTAGTTGCCGAGCGTTGGTGGAATGTGAAGAAAACCAGCGTAACAGAGGACTATGCcgac  >  1:1052371/1‑64 (MQ=255) cttGTTAGTTGCCGAGCGTTGGTGGAATGTGAAGAAAACCAGCGTAACAGAGGACTATGCcgac  >  1:1494597/1‑64 (MQ=255) cttGTTAGTTGCCGAGCGTTGGTGGAATGTGAAGAAAACCAGCGTAACAGAGGACTATGCcgac  >  1:1501261/1‑64 (MQ=255) cttGTTAGTTGCCGAGCGTTGGTGGAATGTGAAGAAAACCAGCGTAACAGAGGACTATGCcgac  >  1:1510768/1‑64 (MQ=255) cttGTTAGTTGCCGAGCGTTGGTGGAATGTGAAGAAAACCAGCGTAACAGAGGACTATGCcgac  >  1:1532137/1‑64 (MQ=255) cttGTTAGTTGCCGAGCGTTGGTGGAATGTGAAGAAAACCAGCGTAACAGAGGACTATGCcgac  >  1:1538799/1‑64 (MQ=255) cttGTTAGTTGCCGAGCGTTGGTGGAATGTGAAGAAAACCAGCGTAACAGAGGACTATGCcgac  >  1:1566527/1‑64 (MQ=255) cttGTTAGTTGCCGAGCGTTGGTGGAATGTGAAGAAAACCAGCGTAACAGAGGACTATGCcgac  >  1:1682804/1‑64 (MQ=255) cttGTTAGTTGCCGAGCGTTGGTGGAATGTGAAGAAAACCAGCGTAACAGAGGACTATGCcgac  >  1:1733094/1‑64 (MQ=255) cttGTTAGTTGCCGAGCGTTGGTGGAATGTGAAGAAAACCAGCGTAACAGAGGACTATGCcgac  >  1:174836/1‑64 (MQ=255)                                                                | CTTGTTAGTTGCCGAGCGTTGGTGGAATGTGAAGAAAACCAGCGTAACAGAGGACTATGCCGAC  >  W3110S.gb/2755135‑2755198

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑