Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	2756146	2756189	44	32 [0]	[0] 2	intA/yfjH	integrase/hypothetical protein

GGCTGATATTTCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGCC  >  W3110S.gb/2756081‑2756145                                                                 | ggCTGATATTTCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTG‑‑CTACTTTCGTTTAGcc  <  1:987292/63‑1 (MQ=255)   cTGATATTTCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGcc  <  1:21329/63‑1 (MQ=255)   cTGATATTTCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGcc  <  1:998254/63‑1 (MQ=255)   cTGATATTTCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGcc  <  1:736773/63‑1 (MQ=255)   cTGATATTTCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGcc  <  1:711939/63‑1 (MQ=255)   cTGATATTTCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGcc  <  1:701774/63‑1 (MQ=255)   cTGATATTTCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGcc  <  1:499931/63‑1 (MQ=255)   cTGATATTTCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGcc  <  1:396508/63‑1 (MQ=255)   cTGATATTTCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGcc  <  1:34685/63‑1 (MQ=255)   cTGATATTTCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGcc  <  1:337859/63‑1 (MQ=255)   cTGATATTTCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGcc  <  1:181612/63‑1 (MQ=255)   cTGATATTTCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGcc  <  1:1807715/63‑1 (MQ=255)   cTGATATTTCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGcc  <  1:1718693/63‑1 (MQ=255)   cTGATATTTCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGcc  <  1:1466193/63‑1 (MQ=255)   cTGATATTTCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGcc  <  1:1446191/63‑1 (MQ=255)   cTGATATTTCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGcc  <  1:1369895/63‑1 (MQ=255)   cTGATATTTCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGcc  <  1:1201025/63‑1 (MQ=255)    tGATATTTCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGcc  <  1:104371/62‑1 (MQ=255)    tGATATTTCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGcc  <  1:312843/62‑1 (MQ=255)          ttCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGcc  <  1:133561/56‑1 (MQ=255)           tCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGcc  <  1:1547721/55‑1 (MQ=255)           tCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGcc  <  1:1515399/55‑1 (MQ=255)           tCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGcc  <  1:462304/55‑1 (MQ=255)            cTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGcc  <  1:1621124/54‑1 (MQ=255)            cTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGcc  <  1:965623/54‑1 (MQ=255)            cTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGcc  <  1:733685/54‑1 (MQ=255)              aaaaGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGcc  <  1:1117042/52‑1 (MQ=255)              aaaaGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGcc  <  1:893383/52‑1 (MQ=255)              aaaaGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGcc  <  1:852602/52‑1 (MQ=255)               aaaGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGcc  <  1:1332132/51‑1 (MQ=255)               aaaGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGcc  <  1:1183480/51‑1 (MQ=255)                aaGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGcc  <  1:1355717/50‑1 (MQ=255)                                                                 | GGCTGATATTTCTAAAAGATCGCACTAAATAGCTACGCGGAATAGTGCTCTACTTTCGTTTAGCC  >  W3110S.gb/2756081‑2756145

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑