Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	231494	231609	116	31 [0]	[0] 54	yafD	conserved hypothetical protein

GCCACAACATCCTTCTGGCGTAATGACCCTTTCGGCGGCACATCCAGTGTATTGCTGCCCGTTA  >  W3110S.gb/231430‑231493                                                                | gcCACAACGTCCTTCTGGCGTAATGACCCTTTCGGCGGCACATCCAGTGTATTGCTGCCCGTTa  <  1:1284198/64‑1 (MQ=255) gcCACAACATCCTTCTGGCGTAATGACCCTTTCGGCGGCACATCCAGTGTATTGCTGCCCGTTa  <  1:1413742/64‑1 (MQ=255) gcCACAACATCCTTCTGGCGTAATGACCCTTTCGGCGGCACATCCAGTGTATTGCTGCCCGTTa  <  1:937096/64‑1 (MQ=255) gcCACAACATCCTTCTGGCGTAATGACCCTTTCGGCGGCACATCCAGTGTATTGCTGCCCGTTa  <  1:927507/64‑1 (MQ=255) gcCACAACATCCTTCTGGCGTAATGACCCTTTCGGCGGCACATCCAGTGTATTGCTGCCCGTTa  <  1:888023/64‑1 (MQ=255) gcCACAACATCCTTCTGGCGTAATGACCCTTTCGGCGGCACATCCAGTGTATTGCTGCCCGTTa  <  1:822803/64‑1 (MQ=255) gcCACAACATCCTTCTGGCGTAATGACCCTTTCGGCGGCACATCCAGTGTATTGCTGCCCGTTa  <  1:68651/64‑1 (MQ=255) gcCACAACATCCTTCTGGCGTAATGACCCTTTCGGCGGCACATCCAGTGTATTGCTGCCCGTTa  <  1:650793/64‑1 (MQ=255) gcCACAACATCCTTCTGGCGTAATGACCCTTTCGGCGGCACATCCAGTGTATTGCTGCCCGTTa  <  1:626779/64‑1 (MQ=255) gcCACAACATCCTTCTGGCGTAATGACCCTTTCGGCGGCACATCCAGTGTATTGCTGCCCGTTa  <  1:474319/64‑1 (MQ=255) gcCACAACATCCTTCTGGCGTAATGACCCTTTCGGCGGCACATCCAGTGTATTGCTGCCCGTTa  <  1:344190/64‑1 (MQ=255) gcCACAACATCCTTCTGGCGTAATGACCCTTTCGGCGGCACATCCAGTGTATTGCTGCCCGTTa  <  1:188030/64‑1 (MQ=255) gcCACAACATCCTTCTGGCGTAATGACCCTTTCGGCGGCACATCCAGTGTATTGCTGCCCGTTa  <  1:1694653/64‑1 (MQ=255) gcCACAACATCCTTCTGGCGTAATGACCCTTTCGGCGGCACATCCAGTGTATTGCTGCCCGTTa  <  1:1613477/64‑1 (MQ=255) gcCACAACATCCTTCTGGCGTAATGACCCTTTCGGCGGCACATCCAGTGTATTGCTGCCCGTTa  <  1:1538923/64‑1 (MQ=255) gcCACAACATCCTTCTGGCGTAATGACCCTTTCGGCGGCACATCCAGTGTATTGCTGCCCGTTa  <  1:1464130/64‑1 (MQ=255) gcCACAACATCCTTCTGGCGTAATGACCCTTTCGGCGGCACATCCAGTGTATTGCTGCCCGTTa  <  1:1014241/64‑1 (MQ=255) gcCACAACATCCTTCTGGCGTAATGACCCTTTCGGCGGCACATCCAGTGTATTGCTGCCCGTTa  <  1:1360187/64‑1 (MQ=255) gcCACAACATCCTTCTGGCGTAATGACCCTTTCGGCGGCACATCCAGTGTATTGCTGCCCGTTa  <  1:1345385/64‑1 (MQ=255) gcCACAACATCCTTCTGGCGTAATGACCCTTTCGGCGGCACATCCAGTGTATTGCTGCCCGTTa  <  1:1343035/64‑1 (MQ=255) gcCACAACATCCTTCTGGCGTAATGACCCTTTCGGCGGCACATCCAGTGTATTGCTGCCCGTTa  <  1:1308951/64‑1 (MQ=255) gcCACAACATCCTTCTGGCGTAATGACCCTTTCGGCGGCACATCCAGTGTATTGCTGCCCGTTa  <  1:1290213/64‑1 (MQ=255) gcCACAACATCCTTCTGGCGTAATGACCCTTTCGGCGGCACATCCAGTGTATTGCTGCCCGTTa  <  1:124135/64‑1 (MQ=255) gcCACAACATCCTTCTGGCGTAATGACCCTTTCGGCGGCACATCCAGTGTATTGCTGCCCGTTa  <  1:1238914/64‑1 (MQ=255) gcCACAACATCCTTCTGGCGTAATGACCCTTTCGGCGGCACATCCAGTGTATTGCTGCCCGTTa  <  1:1197459/64‑1 (MQ=255) gcCACAACATCCTTCTGGCGTAATGACCCTTTCGGCGGCACATCCAGTGTATTGCTGCCCGTTa  <  1:1183406/64‑1 (MQ=255) gcCACAACATCCTTCTGGCGTAATGACCCTTTCGGCGGCACATCCAGTGTATTGCTGCCCGTTa  <  1:1158867/64‑1 (MQ=255) gcCACAACATCCTTCTGGCGTAATGACCCTTTCGGCGGCACATCCAGTGTATTGCTGCCCGTTa  <  1:1153881/64‑1 (MQ=255) gcCACAACATCCTTCTGGCGTAATGACCCTTTCGGCGGCACATCCAGTGTATTGCTGCCCGTTa  <  1:1016539/64‑1 (MQ=255) gcCACAACATCCTTCTGGCGTAATGACCCTTTCGGCGGCACATCCAGCGTATTGCTGCCCGTTa  <  1:225101/64‑1 (MQ=255) gcCACAACATCCTTCTGGCGTAATGACCCTTTCGGAGGCACATCCAGTGTATTGCTGCCCGTTa  <  1:102338/64‑1 (MQ=255)                                                                | GCCACAACATCCTTCTGGCGTAATGACCCTTTCGGCGGCACATCCAGTGTATTGCTGCCCGTTA  >  W3110S.gb/231430‑231493

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑