Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2779977	2780166	190	47 [0]	[0] 26	ypjA	adhesin‑like autotransporter

TCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAG  >  W3110S.gb/2779912‑2779976                                                                 | tCAGTTCGCCGGTATTTTCGAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:1852855/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGATGTgagag  >  1:1648574/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:392088/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:1879415/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:1882832/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:202112/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:241371/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:271444/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:296351/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:33219/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:348268/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:371815/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:1809712/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:426766/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:508788/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:513989/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:554402/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:566114/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:599879/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:690915/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:743309/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:744142/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:857043/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:977208/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:1463602/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:1089526/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:1130312/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:1139334/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:1158984/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:1166204/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:1231866/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:130322/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:1412813/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:1433445/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:1452294/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:105063/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:1478155/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:1504720/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:1513989/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:1568300/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:161677/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:1660028/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:1701236/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:1747916/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:1768466/1‑65 (MQ=255) tCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:1800114/1‑65 (MQ=255) tCAGTTAGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTgagag  >  1:87266/1‑65 (MQ=255)                                                                 | TCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAG  >  W3110S.gb/2779912‑2779976

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑