Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2780475	2780602	128	88 [0]	[0] 15	ypjA	adhesin‑like autotransporter

TAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCT  >  W3110S.gb/2780411‑2780474                                                                | tAAATGACGACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:842435/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCTCGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:1396664/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACTTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:574505/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:336328/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:488420/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:45764/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:450362/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:436366/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:432379/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:427931/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:379558/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:360158/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:339764/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:515821/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:229374/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:218148/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:207518/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:1886798/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:1884776/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:1876653/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:1858685/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:1075889/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:18230/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:680920/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:956698/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:893129/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:888399/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:881066/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:77165/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:762432/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:723964/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:711986/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:697354/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:494089/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:67130/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:609675/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:597489/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:593712/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:583805/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:565253/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:52243/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:1852657/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:49681/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:1247436/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:1812304/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:1439315/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:1439174/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:1410642/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:13969/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:1396413/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:138352/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:1371178/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:1296436/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:1456538/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:1231799/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:1196843/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:1189944/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:1177916/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:1151846/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:1145524/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:1139944/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:1116202/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:1100962/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:1636848/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:1806610/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:1795118/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:1771649/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:1771414/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:1720967/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:1707977/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:167712/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:1656855/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:1653940/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:1527041/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:163550/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:1630113/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:1592374/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:1571947/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:1566451/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:153843/64‑1 (MQ=255) tAAATGACCACCGTTCTCCATCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:953044/64‑1 (MQ=255)  aaaTGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:360993/63‑1 (MQ=255)  aaaTGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:418875/63‑1 (MQ=255)  aaaTGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:1123586/63‑1 (MQ=255)     tGAGCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:575505/60‑1 (MQ=255)             gTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:1399828/52‑1 (MQ=255)             gTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:1751701/52‑1 (MQ=255)                  ccAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCt  <  1:1479368/47‑1 (MQ=255)                                                                | TAAATGACCACCGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCT  >  W3110S.gb/2780411‑2780474

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑