Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2780986	2780987	2	44 [0]	[0] 63	ypjA	adhesin‑like autotransporter

GAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGC  >  W3110S.gb/2780921‑2780985                                                                 | gAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACTCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:1230539/65‑1 (MQ=255) gAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:590582/65‑1 (MQ=255) gAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:1875206/65‑1 (MQ=255) gAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:1882517/65‑1 (MQ=255) gAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:252057/65‑1 (MQ=255) gAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:267383/65‑1 (MQ=255) gAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:278461/65‑1 (MQ=255) gAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:352793/65‑1 (MQ=255) gAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:401697/65‑1 (MQ=255) gAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:517112/65‑1 (MQ=255) gAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:551115/65‑1 (MQ=255) gAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:57271/65‑1 (MQ=255) gAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:184553/65‑1 (MQ=255) gAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:687635/65‑1 (MQ=255) gAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:689516/65‑1 (MQ=255) gAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:8030/65‑1 (MQ=255) gAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:834885/65‑1 (MQ=255) gAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:876510/65‑1 (MQ=255) gAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:89522/65‑1 (MQ=255) gAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:93512/65‑1 (MQ=255) gAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:964396/65‑1 (MQ=255) gAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:984271/65‑1 (MQ=255) gAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:1540638/65‑1 (MQ=255) gAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:1089211/65‑1 (MQ=255) gAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:1167171/65‑1 (MQ=255) gAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:1213620/65‑1 (MQ=255) gAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:1214758/65‑1 (MQ=255) gAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:1273159/65‑1 (MQ=255) gAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:136426/65‑1 (MQ=255) gAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:1368639/65‑1 (MQ=255) gAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:1402884/65‑1 (MQ=255) gAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:1453972/65‑1 (MQ=255) gAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:1482451/65‑1 (MQ=255) gAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:1017307/65‑1 (MQ=255) gAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:155302/65‑1 (MQ=255) gAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:1584004/65‑1 (MQ=255) gAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:1669038/65‑1 (MQ=255) gAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:172513/65‑1 (MQ=255) gAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:1804942/65‑1 (MQ=255) gAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:1808892/65‑1 (MQ=255) gAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:1811863/65‑1 (MQ=255) gAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:1831569/65‑1 (MQ=255) gAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:1841185/65‑1 (MQ=255)                         ctctACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGc  <  1:280554/41‑1 (MQ=255)                                                                 | GAGTATTCCATTCGCACTCCCTCCCTCTACGCGTGAAGCACCGCCCTTAATTGTCGTTCCATTGC  >  W3110S.gb/2780921‑2780985

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑