Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2783450	2783580	131	43 [0]	[0] 6	ypjC	hypothetical protein

TACCTTTAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCATA  >  W3110S.gb/2783386‑2783449                                                                | tACCTTTAAGTTATTTTCACCATCTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCATa  <  1:102932/64‑1 (MQ=255) tACCTTTAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCGTa  <  1:875265/64‑1 (MQ=255) tACCTTTAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCATa  <  1:684194/64‑1 (MQ=255) tACCTTTAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCATa  <  1:275061/64‑1 (MQ=255) tACCTTTAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCATa  <  1:292404/64‑1 (MQ=255) tACCTTTAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCATa  <  1:320240/64‑1 (MQ=255) tACCTTTAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCATa  <  1:476600/64‑1 (MQ=255) tACCTTTAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCATa  <  1:477483/64‑1 (MQ=255) tACCTTTAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCATa  <  1:505299/64‑1 (MQ=255) tACCTTTAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCATa  <  1:509048/64‑1 (MQ=255) tACCTTTAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCATa  <  1:515060/64‑1 (MQ=255) tACCTTTAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCATa  <  1:648978/64‑1 (MQ=255) tACCTTTAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCATa  <  1:649476/64‑1 (MQ=255) tACCTTTAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCATa  <  1:213855/64‑1 (MQ=255) tACCTTTAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCATa  <  1:733561/64‑1 (MQ=255) tACCTTTAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCATa  <  1:740533/64‑1 (MQ=255) tACCTTTAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCATa  <  1:824005/64‑1 (MQ=255) tACCTTTAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCATa  <  1:829634/64‑1 (MQ=255) tACCTTTAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCATa  <  1:846474/64‑1 (MQ=255) tACCTTTAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCATa  <  1:936227/64‑1 (MQ=255) tACCTTTAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCATa  <  1:952200/64‑1 (MQ=255) tACCTTTAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCATa  <  1:978863/64‑1 (MQ=255) tACCTTTAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCATa  <  1:1570213/64‑1 (MQ=255) tACCTTTAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCATa  <  1:102380/64‑1 (MQ=255) tACCTTTAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCATa  <  1:1053130/64‑1 (MQ=255) tACCTTTAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCATa  <  1:1242899/64‑1 (MQ=255) tACCTTTAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCATa  <  1:1287560/64‑1 (MQ=255) tACCTTTAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCATa  <  1:1305201/64‑1 (MQ=255) tACCTTTAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCATa  <  1:1375883/64‑1 (MQ=255) tACCTTTAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCATa  <  1:1478467/64‑1 (MQ=255) tACCTTTAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCATa  <  1:1535496/64‑1 (MQ=255) tACCTTTAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCATa  <  1:10171/64‑1 (MQ=255) tACCTTTAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCATa  <  1:1595800/64‑1 (MQ=255) tACCTTTAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCATa  <  1:1690998/64‑1 (MQ=255) tACCTTTAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCATa  <  1:1705162/64‑1 (MQ=255) tACCTTTAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCATa  <  1:1763052/64‑1 (MQ=255) tACCTTTAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCATa  <  1:181858/64‑1 (MQ=255) tACCTTTAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCATa  <  1:1829230/64‑1 (MQ=255) tACCTTTAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCATa  <  1:1862975/64‑1 (MQ=255) tACCTTTAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTCCTCCAGCTCCCATa  <  1:1558867/64‑1 (MQ=255)       tAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCGCATa  <  1:321091/58‑1 (MQ=255)                       aCTTCATATTTTATAGGTTTTAATTGTTCTCGAGCTCCCATa  <  1:202238/42‑1 (MQ=37)                         ttCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCATa  <  1:1440065/40‑1 (MQ=255)                                                                | TACCTTTAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCATA  >  W3110S.gb/2783386‑2783449

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑