Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2784129	2784175	47	35 [0]	[0] 19	ypjC/ileY	hypothetical protein/tRNA‑Ile

ACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTG  >  W3110S.gb/2784074‑2784128                                                       | aCTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTg  <  1:738707/55‑1 (MQ=255) aCTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTg  <  1:271272/55‑1 (MQ=255) aCTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTg  <  1:292335/55‑1 (MQ=255) aCTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTg  <  1:293441/55‑1 (MQ=255) aCTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTg  <  1:325523/55‑1 (MQ=255) aCTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTg  <  1:39460/55‑1 (MQ=255) aCTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTg  <  1:538113/55‑1 (MQ=255) aCTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTg  <  1:566110/55‑1 (MQ=255) aCTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTg  <  1:719981/55‑1 (MQ=255) aCTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTg  <  1:24515/55‑1 (MQ=255) aCTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTg  <  1:765880/55‑1 (MQ=255) aCTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTg  <  1:854289/55‑1 (MQ=255) aCTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTg  <  1:867996/55‑1 (MQ=255) aCTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTg  <  1:877485/55‑1 (MQ=255) aCTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTg  <  1:896019/55‑1 (MQ=255) aCTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTg  <  1:957072/55‑1 (MQ=255) aCTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTg  <  1:982382/55‑1 (MQ=255) aCTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTg  <  1:996061/55‑1 (MQ=255) aCTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTg  <  1:1541654/55‑1 (MQ=255) aCTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTg  <  1:1123535/55‑1 (MQ=255) aCTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTg  <  1:12505/55‑1 (MQ=255) aCTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTg  <  1:1255126/55‑1 (MQ=255) aCTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTg  <  1:1374327/55‑1 (MQ=255) aCTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTg  <  1:1521507/55‑1 (MQ=255) aCTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTg  <  1:152651/55‑1 (MQ=255) aCTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTg  <  1:1016387/55‑1 (MQ=255) aCTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTg  <  1:1663222/55‑1 (MQ=255) aCTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTg  <  1:1682339/55‑1 (MQ=255) aCTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTg  <  1:1686137/55‑1 (MQ=255) aCTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTg  <  1:1715050/55‑1 (MQ=255) aCTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTg  <  1:1796065/55‑1 (MQ=255) aCTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTg  <  1:1798380/55‑1 (MQ=255) aCTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTg  <  1:1878516/55‑1 (MQ=255) aCTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCACTGATTTGAGTAATTAACCTg  <  1:1304081/55‑1 (MQ=255) aCTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGCTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTg  <  1:1336359/55‑1 (MQ=255)                                                       | ACTTATCATCAGTGAGCGAACAGAGAATAGTTCAGTGATTTGAGTAATTAACCTG  >  W3110S.gb/2784074‑2784128

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑