Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2809147	2809156	10	29 [0]	[0] 7	ygaH	predicted inner membrane protein

TGGGTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGCC  >  W3110S.gb/2809082‑2809146                                                                 | tgGGTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGcc  <  1:943405/65‑1 (MQ=255) tgGGTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGcc  <  1:72841/65‑1 (MQ=255) tgGGTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGcc  <  1:680939/65‑1 (MQ=255) tgGGTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGcc  <  1:647604/65‑1 (MQ=255) tgGGTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGcc  <  1:785066/65‑1 (MQ=255) tgGGTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGcc  <  1:4005/65‑1 (MQ=255) tgGGTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGcc  <  1:821036/65‑1 (MQ=255) tgGGTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGcc  <  1:362851/65‑1 (MQ=255) tgGGTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGcc  <  1:328136/65‑1 (MQ=255) tgGGTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGcc  <  1:922938/65‑1 (MQ=255) tgGGTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGcc  <  1:104084/65‑1 (MQ=255) tgGGTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGcc  <  1:1840569/65‑1 (MQ=255) tgGGTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGcc  <  1:1798385/65‑1 (MQ=255) tgGGTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGcc  <  1:1672627/65‑1 (MQ=255) tgGGTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGcc  <  1:1643920/65‑1 (MQ=255) tgGGTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGcc  <  1:1589784/65‑1 (MQ=255) tgGGTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGcc  <  1:1539754/65‑1 (MQ=255) tgGGTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGcc  <  1:1537802/65‑1 (MQ=255) tgGGTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGcc  <  1:1493372/65‑1 (MQ=255) tgGGTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGcc  <  1:1416441/65‑1 (MQ=255) tgGGTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGcc  <  1:1382221/65‑1 (MQ=255) tgGGTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGcc  <  1:1082529/65‑1 (MQ=255) tgGGTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGcc  <  1:1061167/65‑1 (MQ=255)  gggTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGcc  <  1:1855501/64‑1 (MQ=255)  gggTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGcc  <  1:477329/64‑1 (MQ=255)   ggTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGcc  <  1:395316/63‑1 (MQ=255)   ggTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGcc  <  1:183232/63‑1 (MQ=255)         gcccgcccAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGcc  <  1:995839/57‑1 (MQ=255)                               cgGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGcc  <  1:199631/35‑1 (MQ=255)                                                                 | TGGGTAATGCCCGCCCAACCAAACGTGGCGCGGTAGGTATTTTGCTCGACACCATTGGCATCGCC  >  W3110S.gb/2809082‑2809146

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑