Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	239283	239371	89	55 [0]	[0] 20	yafF	conserved hypothetical protein

GAGGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATGAG  >  W3110S.gb/239218‑239282                                                                 | gagGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATATGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:734097/65‑1 (MQ=255) gagGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:153274/65‑1 (MQ=37) gagGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:367731/65‑1 (MQ=37) gagGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:330340/65‑1 (MQ=37) gagGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:3271/65‑1 (MQ=37) gagGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:326513/65‑1 (MQ=37) gagGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:310059/65‑1 (MQ=37) gagGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:595363/65‑1 (MQ=37) gagGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:627978/65‑1 (MQ=37) gagGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:1733661/65‑1 (MQ=37) gagGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:672335/65‑1 (MQ=37) gagGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:1661943/65‑1 (MQ=37) gagGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:676575/65‑1 (MQ=37) gagGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:722859/65‑1 (MQ=37) gagGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:1587811/65‑1 (MQ=37) gagGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:151126/65‑1 (MQ=37) gagGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:95345/65‑1 (MQ=37) gagGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:107397/65‑1 (MQ=37) gagGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:1127517/65‑1 (MQ=37) gagGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:1193371/65‑1 (MQ=37) gagGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:1205311/65‑1 (MQ=37) gagGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:1217637/65‑1 (MQ=37) gagGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:1286363/65‑1 (MQ=37) gagGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:872366/65‑1 (MQ=37) gagGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:1304912/65‑1 (MQ=37) gagGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:855719/65‑1 (MQ=37) gagGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:810540/65‑1 (MQ=37) gagGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:1445355/65‑1 (MQ=37)  agGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:77929/64‑1 (MQ=37)  agGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:450231/64‑1 (MQ=37)  agGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:429258/64‑1 (MQ=37)  agGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:428678/64‑1 (MQ=37)  agGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:731313/64‑1 (MQ=37)  agGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:1065449/64‑1 (MQ=37)  agGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:977986/64‑1 (MQ=37)  agGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:800997/64‑1 (MQ=37)  agGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:1621633/64‑1 (MQ=37)  agGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:1181127/64‑1 (MQ=37)  agGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:1268853/64‑1 (MQ=37)  agGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:1309426/64‑1 (MQ=37)  agGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:1334887/64‑1 (MQ=37)  agGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:1491986/64‑1 (MQ=37)  agGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:1495062/64‑1 (MQ=37)  agGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:1498428/64‑1 (MQ=37)  agGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:1543040/64‑1 (MQ=37)  agGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:1634736/64‑1 (MQ=37)  agGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:1786669/64‑1 (MQ=37)  agGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:1789234/64‑1 (MQ=37)  agGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:180479/64‑1 (MQ=37)  agGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:266775/64‑1 (MQ=37)    gAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:1700933/62‑1 (MQ=37)     aaaCGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:196568/61‑1 (MQ=37)              agAATTATTTTCAGGGATTCGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:1302444/52‑1 (MQ=9)                         cAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:333778/41‑1 (MQ=32)                            ggATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATgag  <  1:577632/38‑1 (MQ=33)                                                                 | GAGGAAACGCAGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATTGCTATTAATATTTTGACGAATGAG  >  W3110S.gb/239218‑239282

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑