Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 2841457 2841565 109 170 [0] [0] 97 hycI protease involved in processing C‑terminal end of HycE

Only 100 of 170 total aligned reads displayed.

CTTTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGC  >  W3110S.gb/2841393‑2841456
                                                               |
ttttCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1186307/2‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCTTGATATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1493287/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:483325/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:647374/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:628930/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:621680/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:617979/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:602844/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:601899/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:592698/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:582283/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:573822/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:568243/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:493714/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:665343/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:472147/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:465654/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:46425/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:456811/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:438087/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:381502/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:355735/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:306928/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:295838/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:291970/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:248980/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:811304/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:979017/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:954195/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:950836/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:931819/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:921868/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:904809/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:896639/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:888148/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:876110/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:875807/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:835968/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:83106/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:660232/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:801125/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:778858/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:762643/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:751330/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:716295/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:703187/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:700751/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:697177/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:692303/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:67105/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:239510/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1216518/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1342561/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1331473/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1323956/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1301910/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1291264/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1283690/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1267859/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1262160/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1244014/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1237327/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1225247/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1351044/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1204872/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1200057/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1163169/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1136850/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1134123/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1123327/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1102810/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1082235/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1073673/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1053656/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1027613/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1611619/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:231919/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:207676/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1749113/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1730070/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1685075/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1673928/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1667948/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1655224/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1623677/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1613814/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:101772/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1593244/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1525891/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1517118/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1506245/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1506014/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1498495/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:145826/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1453622/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1418775/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1362208/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:1351537/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGGTAGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:396253/1‑64 (MQ=255)
cttTCAACTGATCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGc  >  1:121463/1‑64 (MQ=255)
                                                               |
CTTTCAACTGGTCGATAAGGTAATTCAACGGCATGTTATGGGTAGTCATCATAAACATCTCGGC  >  W3110S.gb/2841393‑2841456

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: