Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2880940	2881096	157	37 [0]	[0] 118	ygcK	hypothetical protein

CACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCG  >  W3110S.gb/2880875‑2880939                                                                 | caccaTGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGGTCGGCGTTAGTAAGTAATCg  <  1:1558295/65‑1 (MQ=255) caccaGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCg  <  1:491091/65‑1 (MQ=255) caccaGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCg  <  1:1733649/65‑1 (MQ=255) caccaGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCg  <  1:1789011/65‑1 (MQ=255) caccaGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCg  <  1:285349/65‑1 (MQ=255) caccaGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCg  <  1:382493/65‑1 (MQ=255) caccaGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCg  <  1:382711/65‑1 (MQ=255) caccaGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCg  <  1:457116/65‑1 (MQ=255) caccaGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCg  <  1:476826/65‑1 (MQ=255) caccaGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCg  <  1:1711608/65‑1 (MQ=255) caccaGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCg  <  1:687826/65‑1 (MQ=255) caccaGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCg  <  1:864313/65‑1 (MQ=255) caccaGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCg  <  1:87166/65‑1 (MQ=255) caccaGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCg  <  1:87905/65‑1 (MQ=255) caccaGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCg  <  1:890663/65‑1 (MQ=255) caccaGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCg  <  1:950453/65‑1 (MQ=255) caccaGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCg  <  1:978529/65‑1 (MQ=255) caccaGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCg  <  1:983224/65‑1 (MQ=255) caccaGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCg  <  1:1436089/65‑1 (MQ=255) caccaGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCg  <  1:1132483/65‑1 (MQ=255) caccaGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCg  <  1:1252004/65‑1 (MQ=255) caccaGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCg  <  1:1297149/65‑1 (MQ=255) caccaGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCg  <  1:1325106/65‑1 (MQ=255) caccaGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCg  <  1:1326543/65‑1 (MQ=255) caccaGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCg  <  1:1330427/65‑1 (MQ=255) caccaGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCg  <  1:1053115/65‑1 (MQ=255) caccaGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCg  <  1:1437039/65‑1 (MQ=255) caccaGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCg  <  1:1491855/65‑1 (MQ=255) caccaGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCg  <  1:150869/65‑1 (MQ=255) caccaGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCg  <  1:1576791/65‑1 (MQ=255) caccaGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCg  <  1:1616814/65‑1 (MQ=255) caccaGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTGCGGCGTGAGTAAGTAATCg  <  1:1478769/65‑1 (MQ=255) caccaGGGCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCg  <  1:721397/65‑1 (MQ=255)  accaGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCg  <  1:1232056/64‑1 (MQ=255)  accaGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCg  <  1:1218236/64‑1 (MQ=255)  accaGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCg  <  1:1687208/64‑1 (MQ=255)    caGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCg  <  1:280318/62‑1 (MQ=255)                                                                 | CACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCG  >  W3110S.gb/2880875‑2880939

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑