Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2913185	2913480	296	48 [0]	[0] 30	rumA	23S rRNA (uracil‑5)‑methyltransferase

ACATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGT  >  W3110S.gb/2913120‑2913184                                                                 | aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAGGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:380365/65‑1 (MQ=255) aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:456394/65‑1 (MQ=255) aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:1741356/65‑1 (MQ=255) aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:1793406/65‑1 (MQ=255) aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:1808807/65‑1 (MQ=255) aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:231393/65‑1 (MQ=255) aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:349741/65‑1 (MQ=255) aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:351585/65‑1 (MQ=255) aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:437609/65‑1 (MQ=255) aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:445770/65‑1 (MQ=255) aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:454243/65‑1 (MQ=255) aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:455993/65‑1 (MQ=255) aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:1062290/65‑1 (MQ=255) aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:521525/65‑1 (MQ=255) aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:536253/65‑1 (MQ=255) aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:537347/65‑1 (MQ=255) aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:548610/65‑1 (MQ=255) aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:68550/65‑1 (MQ=255) aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:708608/65‑1 (MQ=255) aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:738358/65‑1 (MQ=255) aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:793172/65‑1 (MQ=255) aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:806677/65‑1 (MQ=255) aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:806820/65‑1 (MQ=255) aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:865102/65‑1 (MQ=255) aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:1649181/65‑1 (MQ=255) aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:1014391/65‑1 (MQ=255) aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:1067280/65‑1 (MQ=255) aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:1102316/65‑1 (MQ=255) aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:1149885/65‑1 (MQ=255) aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:1211403/65‑1 (MQ=255) aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:121441/65‑1 (MQ=255) aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:1228561/65‑1 (MQ=255) aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:1261106/65‑1 (MQ=255) aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:1277874/65‑1 (MQ=255) aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:1346024/65‑1 (MQ=255) aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:1354724/65‑1 (MQ=255) aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:1370147/65‑1 (MQ=255) aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:1416196/65‑1 (MQ=255) aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:1430532/65‑1 (MQ=255) aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:1441526/65‑1 (MQ=255) aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:1473105/65‑1 (MQ=255) aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:1582043/65‑1 (MQ=255) aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:160165/65‑1 (MQ=255) aCATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:1680334/65‑1 (MQ=255)  cATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:160342/64‑1 (MQ=255)  cATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:1603717/64‑1 (MQ=255)  cATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:872426/64‑1 (MQ=255)                        aTGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGt  <  1:1574619/42‑1 (MQ=255)                                                                 | ACATGCCCTGACTTTGGGCAGCAATGCTTCAAGTTGGGGCGCTAAAATGGGGCATTGTTTGACGT  >  W3110S.gb/2913120‑2913184

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑