Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2940612	2940651	40	89 [0]	[0] 17	gcvA	DNA‑binding transcriptional dual regulator

CACCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCG  >  W3110S.gb/2940546‑2940611                                                                  | caCCATGGCGCTATGGCT‑AAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:518364/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTTAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:1102840/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGGTTTAACCCCAACTGTCg  <  1:415934/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:314419/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:57599/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:573282/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:562002/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:435186/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:429109/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:422351/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:400920/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:345009/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:323341/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:579520/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:306361/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:263856/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:261092/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:25051/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:217488/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:203184/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:199068/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:1881960/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:1852826/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:837897/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:981549/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:976473/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:931503/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:929880/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:923152/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:916889/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:905244/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:884481/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:883067/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:879654/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:579061/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:747278/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:74167/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:734887/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:712243/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:707713/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:695478/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:631046/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:605030/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:582035/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:1847745/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:1124947/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:1350433/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:1313300/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:1257173/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:1255806/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:1191753/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:1173188/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:1162846/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:1160036/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:1130404/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:183137/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:1123158/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:111892/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:1098234/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:1087563/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:1083245/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:1063486/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:1063469/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:1050006/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:1031503/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:1613410/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:1021562/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:1819443/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:1772062/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:1749435/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:1737128/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:1671861/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:1647871/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:1639557/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:1364397/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:1561214/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:155608/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:1547710/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:1512720/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:1454431/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:1422678/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:1394177/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:1369613/65‑1 (MQ=255)  aCCATGGCGCTATGGCTAAAAATTAGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:1108613/65‑1 (MQ=255)   ccATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:1269513/64‑1 (MQ=255)         cgcTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGATCGTTGATATGATTTAAGCCCAACTGTCg  <  1:1062236/58‑1 (MQ=255)           cTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:1621779/56‑1 (MQ=255)            tATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCg  <  1:1235895/55‑1 (MQ=255)                       aTTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCATCTGTCg  <  1:642848/44‑1 (MQ=255)                                                                  | CACCATGGCGCTATGGCTAAAAATTGGCCCTTGCTGAACGTTGATATGATTTAACCCCAACTGTCG  >  W3110S.gb/2940546‑2940611

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑