Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2943953	2944048	96	59 [0]	[0] 4	ygdL	conserved hypothetical protein

ACGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTC  >  W3110S.gb/2943888‑2943952                                                                 | acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCGAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:1679707/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:482351/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:1104604/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:280247/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:290722/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:292699/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:306297/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:327993/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:343713/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:355960/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:397761/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:399601/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:402133/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:451711/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:476591/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:266166/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:49796/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:559801/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:589182/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:602130/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:614738/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:653964/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:664120/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:678934/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:740499/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:786853/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:813230/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:819905/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:954143/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:1626266/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:1185933/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:1306700/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:1312170/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:1334615/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:1404431/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:1429591/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:1436297/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:1551433/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:1556762/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:1583906/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:1603555/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:1613182/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:166719/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:1667385/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:1681566/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:1695494/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:1697264/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:1715853/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:1772108/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:1856729/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:1864823/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:1884459/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:210022/65‑1 (MQ=255) acGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCGTTTCAGGCGCTc  <  1:137098/65‑1 (MQ=255)  cGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:739922/64‑1 (MQ=255)   gCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:1873163/63‑1 (MQ=255)        ccACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:221844/58‑1 (MQ=255)           cGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:412050/55‑1 (MQ=255)                         ttACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTc  <  1:314591/41‑1 (MQ=255)                                                                 | ACGCAATCCACGCCGAGCTTACCTTTACTGTTTTTCACTACGCCAAAATCGCTTTTCAGGCGCTC  >  W3110S.gb/2943888‑2943952

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑