Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2947215	2947346	132	35 [0]	[0] 26	amiC	N‑acetylmuramoyl‑L‑alanine amidase

CTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCC  >  W3110S.gb/2947150‑2947214                                                                 | cTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTcc  <  1:713726/65‑1 (MQ=255) cTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTcc  <  1:282127/65‑1 (MQ=255) cTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTcc  <  1:329008/65‑1 (MQ=255) cTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTcc  <  1:341256/65‑1 (MQ=255) cTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTcc  <  1:36330/65‑1 (MQ=255) cTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTcc  <  1:390107/65‑1 (MQ=255) cTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTcc  <  1:505780/65‑1 (MQ=255) cTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTcc  <  1:55017/65‑1 (MQ=255) cTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTcc  <  1:697361/65‑1 (MQ=255) cTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTcc  <  1:256944/65‑1 (MQ=255) cTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTcc  <  1:719075/65‑1 (MQ=255) cTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTcc  <  1:834963/65‑1 (MQ=255) cTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTcc  <  1:840960/65‑1 (MQ=255) cTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTcc  <  1:87423/65‑1 (MQ=255) cTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTcc  <  1:89569/65‑1 (MQ=255) cTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTcc  <  1:912266/65‑1 (MQ=255) cTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTcc  <  1:991567/65‑1 (MQ=255) cTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTcc  <  1:1340977/65‑1 (MQ=255) cTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTcc  <  1:1051693/65‑1 (MQ=255) cTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTcc  <  1:1087760/65‑1 (MQ=255) cTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTcc  <  1:1121831/65‑1 (MQ=255) cTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTcc  <  1:1137637/65‑1 (MQ=255) cTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTcc  <  1:1146428/65‑1 (MQ=255) cTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTcc  <  1:1193790/65‑1 (MQ=255) cTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTcc  <  1:1247611/65‑1 (MQ=255) cTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTcc  <  1:1302334/65‑1 (MQ=255) cTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTcc  <  1:1046025/65‑1 (MQ=255) cTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTcc  <  1:1400711/65‑1 (MQ=255) cTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTcc  <  1:1503221/65‑1 (MQ=255) cTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTcc  <  1:1558259/65‑1 (MQ=255) cTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTcc  <  1:1691581/65‑1 (MQ=255) cTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTcc  <  1:19286/65‑1 (MQ=255) cTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTcc  <  1:215196/65‑1 (MQ=255) cTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGGCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTcc  <  1:588609/65‑1 (MQ=255)            tGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTcc  <  1:1552992/54‑1 (MQ=255)                                                                 | CTGGCGGCACCTGCTTTTCGAGGTCGCCTTTGTTGTAATCCTCCAGCAGCGCCAGCAGCGGGTCC  >  W3110S.gb/2947150‑2947214

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑