Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2957283	2957435	153	56 [0]	[0] 9	ptr	protease III

CCAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGC  >  W3110S.gb/2957219‑2957282                                                                | ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:525920/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:1006129/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:1886751/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:214672/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:221143/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:241716/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:300636/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:31166/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:34113/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:373585/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:391938/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:443890/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:483418/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:485310/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:1882695/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:546947/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:681844/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:724907/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:725589/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:750014/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:751105/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:758271/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:789676/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:88503/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:885704/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:92215/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:954405/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:1391998/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:1021543/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:1044011/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:1057891/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:1087774/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:1094258/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:1167680/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:1194271/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:1228294/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:1230575/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:1248766/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:1298951/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:1374579/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:1880366/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:1503702/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:1549709/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:1558239/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:1568430/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:1578552/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:1655029/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:167030/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:1670308/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:1708522/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:1735779/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:1806194/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:1813601/64‑1 (MQ=255) ccAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTCCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:657443/64‑1 (MQ=255)              cTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:34758/51‑1 (MQ=255)                      aCTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGc  <  1:1034259/43‑1 (MQ=255)                                                                | CCAGACTGTCAGCCTGCGGGTACTTTTTCGACCCCATCAGACTCATATGTTCAAGGTAATGTGC  >  W3110S.gb/2957219‑2957282

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑