Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 2986628 2986643 16 158 [0] [0] 101 yqeH conserved hypothetical protein with bipartite regulator domain

Only 100 of 158 total aligned reads displayed.

GATGATGGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAT  >  W3110S.gb/2986564‑2986627
                                                               |
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGTCAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:533790/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTTGTCGTTATTTATCAt  <  1:1330819/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:260343/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:413548/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:401848/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:393184/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:386915/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:38601/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:374536/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:361553/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:323854/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:280924/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:262546/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:498174/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:217652/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:216304/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:213165/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:209051/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:205029/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1884605/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1851767/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1839536/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:103624/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1818723/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1809291/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:730618/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:963665/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:955025/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:949481/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:933448/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:928295/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:873226/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:848106/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:766405/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:766262/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:742840/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:494720/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:703873/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:661296/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:621870/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:608507/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:557851/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:543571/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:539849/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:535986/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:500619/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1832795/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1252319/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1808567/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1395599/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1391050/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1371530/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1338256/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1338054/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1312446/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1303009/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1283697/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1273284/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:125660/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1437759/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1248668/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:122512/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:114913/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1146672/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:113939/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1110893/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1101052/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1095460/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1057328/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1051208/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1047281/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1565113/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1705865/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1697164/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1653285/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1651078/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1641282/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1612639/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1610962/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1601354/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1717502/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1584133/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1775565/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1778902/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1552015/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1791642/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1524407/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:15050/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1465262/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1451737/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1451015/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1445236/64‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:1795010/64‑1 (MQ=255)
 atgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:8300/63‑1 (MQ=255)
  tgatgTTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:436946/62‑1 (MQ=255)
  tgatgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:373544/62‑1 (MQ=255)
    atgGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:600920/60‑1 (MQ=255)
         cTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:58734/55‑1 (MQ=255)
             aTGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:428749/51‑1 (MQ=255)
                             gATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAt  <  1:642811/35‑1 (MQ=255)
                                                               |
GATGATGGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCAT  >  W3110S.gb/2986564‑2986627

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑