Missing coverage evidence...
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CTGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGT  >  W3110S.gb/256326‑256391                                                                  | cTGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATAT‑CCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:437975/65‑1 (MQ=255)  tGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:421704/65‑1 (MQ=255)  tGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:1029494/65‑1 (MQ=255)  tGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:1780476/65‑1 (MQ=255)  tGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:1799556/65‑1 (MQ=255)  tGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:1814404/65‑1 (MQ=255)  tGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:1842432/65‑1 (MQ=255)  tGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:1843262/65‑1 (MQ=255)  tGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:18995/65‑1 (MQ=255)  tGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:211655/65‑1 (MQ=255)  tGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:224435/65‑1 (MQ=255)  tGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:409559/65‑1 (MQ=255)  tGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:412665/65‑1 (MQ=255)  tGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:1749365/65‑1 (MQ=255)  tGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:449540/65‑1 (MQ=255)  tGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:524506/65‑1 (MQ=255)  tGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:585343/65‑1 (MQ=255)  tGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:626423/65‑1 (MQ=255)  tGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:674002/65‑1 (MQ=255)  tGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:846749/65‑1 (MQ=255)  tGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:85971/65‑1 (MQ=255)  tGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:917763/65‑1 (MQ=255)  tGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:969731/65‑1 (MQ=255)  tGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:1289060/65‑1 (MQ=255)  tGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:1058171/65‑1 (MQ=255)  tGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:1070452/65‑1 (MQ=255)  tGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:1115311/65‑1 (MQ=255)  tGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:1125958/65‑1 (MQ=255)  tGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:1173735/65‑1 (MQ=255)  tGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:1177883/65‑1 (MQ=255)  tGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:1186804/65‑1 (MQ=255)  tGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:1194822/65‑1 (MQ=255)  tGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:1233076/65‑1 (MQ=255)  tGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:1256004/65‑1 (MQ=255)  tGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:1725740/65‑1 (MQ=255)  tGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:1310387/65‑1 (MQ=255)  tGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:1422913/65‑1 (MQ=255)  tGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:1432568/65‑1 (MQ=255)  tGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:1532871/65‑1 (MQ=255)  tGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:1573377/65‑1 (MQ=255)  tGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:169383/65‑1 (MQ=255)  tGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:1701705/65‑1 (MQ=255)  tGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:1719339/65‑1 (MQ=255)   ggTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:158541/64‑1 (MQ=255)   ggTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:1069222/64‑1 (MQ=255)                                tgATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGt  <  1:1867143/35‑1 (MQ=255)                                                                  | CTGGTCGTCCGCTGGTTGATGACTATGTTGTTGATATCCCGCAAGATACCTGGATTGAACAGCCGT  >  W3110S.gb/256326‑256391

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑