Missing coverage evidence...
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CGAGATCGACGCGAGCTTCCGGGACGTCCGGGTCCGGGCACACGCTAATGTGGCCCAGCTCGTTA  >  W3110S.gb/3084351‑3084415                                                                 | cgAGTTCGACGCGAGCTTCCGGGACGTCCGGGTCCGGGCACACGCTAATGTGGCCCAGCTCGTTa  <  1:375602/65‑1 (MQ=255) cgAGATCGACGCGAGCTTCCGGGACGTCCGGGTCCGGGCACACGCTAATGTGGCCCAGCTCGTTa  <  1:315810/65‑1 (MQ=255) cgAGATCGACGCGAGCTTCCGGGACGTCCGGGTCCGGGCACACGCTAATGTGGCCCAGCTCGTTa  <  1:959213/65‑1 (MQ=255) cgAGATCGACGCGAGCTTCCGGGACGTCCGGGTCCGGGCACACGCTAATGTGGCCCAGCTCGTTa  <  1:771027/65‑1 (MQ=255) cgAGATCGACGCGAGCTTCCGGGACGTCCGGGTCCGGGCACACGCTAATGTGGCCCAGCTCGTTa  <  1:695694/65‑1 (MQ=255) cgAGATCGACGCGAGCTTCCGGGACGTCCGGGTCCGGGCACACGCTAATGTGGCCCAGCTCGTTa  <  1:523599/65‑1 (MQ=255) cgAGATCGACGCGAGCTTCCGGGACGTCCGGGTCCGGGCACACGCTAATGTGGCCCAGCTCGTTa  <  1:391236/65‑1 (MQ=255) cgAGATCGACGCGAGCTTCCGGGACGTCCGGGTCCGGGCACACGCTAATGTGGCCCAGCTCGTTa  <  1:353157/65‑1 (MQ=255) cgAGATCGACGCGAGCTTCCGGGACGTCCGGGTCCGGGCACACGCTAATGTGGCCCAGCTCGTTa  <  1:104783/65‑1 (MQ=255) cgAGATCGACGCGAGCTTCCGGGACGTCCGGGTCCGGGCACACGCTAATGTGGCCCAGCTCGTTa  <  1:237167/65‑1 (MQ=255) cgAGATCGACGCGAGCTTCCGGGACGTCCGGGTCCGGGCACACGCTAATGTGGCCCAGCTCGTTa  <  1:1881368/65‑1 (MQ=255) cgAGATCGACGCGAGCTTCCGGGACGTCCGGGTCCGGGCACACGCTAATGTGGCCCAGCTCGTTa  <  1:1742072/65‑1 (MQ=255) cgAGATCGACGCGAGCTTCCGGGACGTCCGGGTCCGGGCACACGCTAATGTGGCCCAGCTCGTTa  <  1:1415245/65‑1 (MQ=255) cgAGATCGACGCGAGCTTCCGGGACGTCCGGGTCCGGGCACACGCTAATGTGGCCCAGCTCGTTa  <  1:1360000/65‑1 (MQ=255) cgAGATCGACGCGAGCTTCCGGGACGTCCGGGTCCGGGCACACGCTAATGTGGCCCAGCTCGTTa  <  1:1297871/65‑1 (MQ=255) cgAGATCGACGCGAGCTTCCGGGACGTCCGGGTCCGGGCACACGCTAATGTGGCCCAGCGCGTTa  <  1:180336/65‑1 (MQ=255)  gagaTCGACGCGAGCTTCCGGGACGTCCGGGTCCGGGCACACGCTAATGTGGCCCAGCTCGTTa  <  1:59215/64‑1 (MQ=255)  gagaTCGACGCGAGCTTCCGGGACGTCCGGGTCCGGGCACACGCTAATGTGGCCCAGCTCGTTa  <  1:1334701/64‑1 (MQ=255)  gagaTCGACGCGAGCTTCCGGGACGTCCGGGTCCGGGCACACGCTAATGTGGCCCAGCTCGTTa  <  1:803618/64‑1 (MQ=255)  gagaTCGACGCGAGCTTCCGGGACGTCCGGGTCCGGGCACACGCTAATGTGGCCCAGCTCGTTa  <  1:1066147/64‑1 (MQ=255)                   ccGGGACGTCCGGGTCCGGGCACACGCTAATGTGGCCCAGCTCGTTa  <  1:403266/47‑1 (MQ=255)                                                                 | CGAGATCGACGCGAGCTTCCGGGACGTCCGGGTCCGGGCACACGCTAATGTGGCCCAGCTCGTTA  >  W3110S.gb/3084351‑3084415

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑