Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 3088707 3088802 96 162 [0] [0] 179 sprT conserved hypothetical protein

Only 100 of 162 total aligned reads displayed.

CACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTG  >  W3110S.gb/3088642‑3088706
                                                                |
cACGTACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1353768/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGTCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1781867/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:330947/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:554877/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:541488/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:518787/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:508443/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:507544/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:489515/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:478714/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:378946/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:354627/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:354152/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:345488/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:60355/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:311360/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:300455/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:295687/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:271197/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:265724/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:263926/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:250246/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:214422/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1881112/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1870277/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1012799/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:817091/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:970819/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:952313/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:936832/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:924833/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:891287/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:875980/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:845160/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:835917/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:827271/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:822698/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:819958/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1853565/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:804240/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:766407/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:722124/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:710468/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:689756/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:67080/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:669062/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:661783/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:645687/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:640007/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:620633/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1209969/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1422048/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1847705/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1386978/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1343586/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1339698/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1335385/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:131852/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1298572/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1280845/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1262219/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1239158/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1419197/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1201618/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1161338/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:113250/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1108911/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1108284/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1077056/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1067896/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1027124/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1022044/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1017916/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1667309/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1829577/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1822873/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1802866/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1783237/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1756105/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1727091/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:169326/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1674206/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1454977/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:161429/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1583929/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:156399/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1547334/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1517181/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:150340/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1502947/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1479695/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1464804/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGactg  <  1:2430/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGactg  <  1:241925/65‑1 (MQ=255)
cACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTCCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1134594/65‑1 (MQ=255)
 aCGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1641522/64‑1 (MQ=255)
    aaCTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1122003/61‑1 (MQ=255)
     aCTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGTCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1082140/60‑1 (MQ=255)
               ttGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:45330/50‑1 (MQ=255)
                      tATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGagtg  <  1:1301400/43‑1 (MQ=255)
                                                                |
CACGAACTGGCACATTTGCTGGTATGGAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTG  >  W3110S.gb/3088642‑3088706

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑