Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3090266	3090322	57	22 [0]	[0] 18	yggJ	hypothetical protein

GCCTGTGAGCAGTGTGGTCGTAACCGGGTGCCGGAAATCCGTCCAGCGATGGATCTGGAAGCCTG  >  W3110S.gb/3090201‑3090265                                                                 | gcCTGTGAGCAGTGTGGTCGTAACCGGGTGCCGGAAATCCGTCCAGCGATGGATCTGGAAGCCTg  >  1:223470/1‑65 (MQ=255) gcCTGTGAGCAGTGTGGTCGTAACCGGGTGCCGGAAATCCGTCCAGCGATGGATCTGGAAGCCTg  >  1:896095/1‑65 (MQ=255) gcCTGTGAGCAGTGTGGTCGTAACCGGGTGCCGGAAATCCGTCCAGCGATGGATCTGGAAGCCTg  >  1:861569/1‑65 (MQ=255) gcCTGTGAGCAGTGTGGTCGTAACCGGGTGCCGGAAATCCGTCCAGCGATGGATCTGGAAGCCTg  >  1:776434/1‑65 (MQ=255) gcCTGTGAGCAGTGTGGTCGTAACCGGGTGCCGGAAATCCGTCCAGCGATGGATCTGGAAGCCTg  >  1:704985/1‑65 (MQ=255) gcCTGTGAGCAGTGTGGTCGTAACCGGGTGCCGGAAATCCGTCCAGCGATGGATCTGGAAGCCTg  >  1:626080/1‑65 (MQ=255) gcCTGTGAGCAGTGTGGTCGTAACCGGGTGCCGGAAATCCGTCCAGCGATGGATCTGGAAGCCTg  >  1:56780/1‑65 (MQ=255) gcCTGTGAGCAGTGTGGTCGTAACCGGGTGCCGGAAATCCGTCCAGCGATGGATCTGGAAGCCTg  >  1:542441/1‑65 (MQ=255) gcCTGTGAGCAGTGTGGTCGTAACCGGGTGCCGGAAATCCGTCCAGCGATGGATCTGGAAGCCTg  >  1:439729/1‑65 (MQ=255) gcCTGTGAGCAGTGTGGTCGTAACCGGGTGCCGGAAATCCGTCCAGCGATGGATCTGGAAGCCTg  >  1:378601/1‑65 (MQ=255) gcCTGTGAGCAGTGTGGTCGTAACCGGGTGCCGGAAATCCGTCCAGCGATGGATCTGGAAGCCTg  >  1:35910/1‑65 (MQ=255) gcCTGTGAGCAGTGTGGTCGTAACCGGGTGCCGGAAATCCGTCCAGCGATGGATCTGGAAGCCTg  >  1:1013519/1‑65 (MQ=255) gcCTGTGAGCAGTGTGGTCGTAACCGGGTGCCGGAAATCCGTCCAGCGATGGATCTGGAAGCCTg  >  1:1787318/1‑65 (MQ=255) gcCTGTGAGCAGTGTGGTCGTAACCGGGTGCCGGAAATCCGTCCAGCGATGGATCTGGAAGCCTg  >  1:1719669/1‑65 (MQ=255) gcCTGTGAGCAGTGTGGTCGTAACCGGGTGCCGGAAATCCGTCCAGCGATGGATCTGGAAGCCTg  >  1:1648613/1‑65 (MQ=255) gcCTGTGAGCAGTGTGGTCGTAACCGGGTGCCGGAAATCCGTCCAGCGATGGATCTGGAAGCCTg  >  1:1456759/1‑65 (MQ=255) gcCTGTGAGCAGTGTGGTCGTAACCGGGTGCCGGAAATCCGTCCAGCGATGGATCTGGAAGCCTg  >  1:1314487/1‑65 (MQ=255) gcCTGTGAGCAGTGTGGTCGTAACCGGGTGCCGGAAATCCGTCCAGCGATGGATCTGGAAGCCTg  >  1:1294500/1‑65 (MQ=255) gcCTGTGAGCAGTGTGGTCGTAACCGGGTGCCGGAAATCCGTCCAGCGATGGATCTGGAAGCCTg  >  1:1215431/1‑65 (MQ=255) gcCTGTGAGCAGTGTGGTCGTAACCGGGTGCCGGAAATCCGTCCAGCGATGGATCTGGAAGCCTg  >  1:1191008/1‑65 (MQ=255) gcCTGTGAGCAGTGTGGTCGTAACCGGGTGCCGGAAATCCGTCCAGCGATGGATCTGGAAGCCTg  >  1:1180740/1‑65 (MQ=255) gcCTGTGAGCAGTGTGGTCGTAACCGGGTGCCGGAAATCCGTCCAGCGATGGATCTGGAAGCCTg  >  1:1031018/1‑65 (MQ=255)                                                                 | GCCTGTGAGCAGTGTGGTCGTAACCGGGTGCCGGAAATCCGTCCAGCGATGGATCTGGAAGCCTG  >  W3110S.gb/3090201‑3090265

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑