Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3094967	3095239	273	60 [0]	[0] 19	[yggT]–[yggU]	[yggT],[yggU]

CGCCTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGT  >  W3110S.gb/3094902‑3094966                                                                 | cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGGTTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:1684296/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:66466/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:1826989/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:1856609/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:1876528/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:198055/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:27852/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:284466/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:310343/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:323489/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:365171/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:493523/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:584929/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:603510/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:650715/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:1798579/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:681936/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:775464/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:778231/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:828254/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:835075/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:841399/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:846452/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:847888/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:851312/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:855987/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:945715/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:962684/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:974165/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:979195/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:1488833/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:1014233/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:1072656/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:1080325/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:1108560/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:1116176/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:1125367/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:1140545/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:115962/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:1247724/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:1279596/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:1307631/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:1361450/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:139002/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:1392269/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:1538917/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:1634618/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:1639267/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:1700165/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:1702375/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:1705264/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:171079/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:1720614/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:1720885/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:175642/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:1757549/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:1758471/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:1798266/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGAGGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:1817700/1‑65 (MQ=255) cgccTGCTAACGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGt  >  1:100448/1‑65 (MQ=255)                                                                 | CGCCTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGT  >  W3110S.gb/3094902‑3094966

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑