Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3110139	3110166	28	71 [0]	[0] 25	yghE	ECK2964:JW5924:b2969; predicted secretion pathway protein, L‑type protein

CCTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGCC  >  W3110S.gb/3110074‑3110138                                                                 | ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:411752/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:561759/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:540494/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:539385/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:535394/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:472348/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:470271/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:428875/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:423317/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:602869/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:358149/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:345069/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:316176/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:304148/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:301933/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:286189/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:26766/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:220790/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:789802/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:989907/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:950540/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:915963/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:915356/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:905452/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:850497/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:80588/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:7935/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:220102/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:779674/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:76953/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:704905/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:669871/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:657369/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:624300/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:621567/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:1255051/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:1425490/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:1414195/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:1406330/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:1392686/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:1347755/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:1333274/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:1325810/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:128907/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:145172/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:1236395/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:1231878/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:1190056/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:117735/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:1139359/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:1123632/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:1093075/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:1081604/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:1503104/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:1851036/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:1819888/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:1812980/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:1774347/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:1767163/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:1719244/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:168892/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:1687932/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:1586164/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:1578806/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:1562516/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:1548529/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:1546798/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:1544783/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:1530130/1‑65 (MQ=255) ccTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:1029477/1‑65 (MQ=255) ccTGACAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGcc  >  1:364552/1‑65 (MQ=255)                                                                 | CCTGAGAGCGTAAATTCACAATCCGCTTCTGCTCCGGGAACAACGTTAAGAACTGTTCCTCCGCC  >  W3110S.gb/3110074‑3110138

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑