Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3110910	3110982	73	30 [0]	[0] 62	yghF	predicted secretion pathway protein, C‑type protein

TGCTCGTGGATCAGTGAAATCCTGCTGATTTAGCGCAATGGCGATATCGCCTTCCTTGAAACCGC  >  W3110S.gb/3110845‑3110909                                                                 | tGCTCGTGGATCAGTGAAATCCTGCTGATTTAGCGCAATGGCGATATCGCCTTCCTTGAAACCGc  <  1:213785/65‑1 (MQ=255) tGCTCGTGGATCAGTGAAATCCTGCTGATTTAGCGCAATGGCGATATCGCCTTCCTTGAAACCGc  <  1:997461/65‑1 (MQ=255) tGCTCGTGGATCAGTGAAATCCTGCTGATTTAGCGCAATGGCGATATCGCCTTCCTTGAAACCGc  <  1:944123/65‑1 (MQ=255) tGCTCGTGGATCAGTGAAATCCTGCTGATTTAGCGCAATGGCGATATCGCCTTCCTTGAAACCGc  <  1:866605/65‑1 (MQ=255) tGCTCGTGGATCAGTGAAATCCTGCTGATTTAGCGCAATGGCGATATCGCCTTCCTTGAAACCGc  <  1:747751/65‑1 (MQ=255) tGCTCGTGGATCAGTGAAATCCTGCTGATTTAGCGCAATGGCGATATCGCCTTCCTTGAAACCGc  <  1:713648/65‑1 (MQ=255) tGCTCGTGGATCAGTGAAATCCTGCTGATTTAGCGCAATGGCGATATCGCCTTCCTTGAAACCGc  <  1:609798/65‑1 (MQ=255) tGCTCGTGGATCAGTGAAATCCTGCTGATTTAGCGCAATGGCGATATCGCCTTCCTTGAAACCGc  <  1:53279/65‑1 (MQ=255) tGCTCGTGGATCAGTGAAATCCTGCTGATTTAGCGCAATGGCGATATCGCCTTCCTTGAAACCGc  <  1:525101/65‑1 (MQ=255) tGCTCGTGGATCAGTGAAATCCTGCTGATTTAGCGCAATGGCGATATCGCCTTCCTTGAAACCGc  <  1:501909/65‑1 (MQ=255) tGCTCGTGGATCAGTGAAATCCTGCTGATTTAGCGCAATGGCGATATCGCCTTCCTTGAAACCGc  <  1:470776/65‑1 (MQ=255) tGCTCGTGGATCAGTGAAATCCTGCTGATTTAGCGCAATGGCGATATCGCCTTCCTTGAAACCGc  <  1:440707/65‑1 (MQ=255) tGCTCGTGGATCAGTGAAATCCTGCTGATTTAGCGCAATGGCGATATCGCCTTCCTTGAAACCGc  <  1:377814/65‑1 (MQ=255) tGCTCGTGGATCAGTGAAATCCTGCTGATTTAGCGCAATGGCGATATCGCCTTCCTTGAAACCGc  <  1:352244/65‑1 (MQ=255) tGCTCGTGGATCAGTGAAATCCTGCTGATTTAGCGCAATGGCGATATCGCCTTCCTTGAAACCGc  <  1:350476/65‑1 (MQ=255) tGCTCGTGGATCAGTGAAATCCTGCTGATTTAGCGCAATGGCGATATCGCCTTCCTTGAAACCGc  <  1:1016641/65‑1 (MQ=255) tGCTCGTGGATCAGTGAAATCCTGCTGATTTAGCGCAATGGCGATATCGCCTTCCTTGAAACCGc  <  1:199824/65‑1 (MQ=255) tGCTCGTGGATCAGTGAAATCCTGCTGATTTAGCGCAATGGCGATATCGCCTTCCTTGAAACCGc  <  1:1803704/65‑1 (MQ=255) tGCTCGTGGATCAGTGAAATCCTGCTGATTTAGCGCAATGGCGATATCGCCTTCCTTGAAACCGc  <  1:1701428/65‑1 (MQ=255) tGCTCGTGGATCAGTGAAATCCTGCTGATTTAGCGCAATGGCGATATCGCCTTCCTTGAAACCGc  <  1:1673591/65‑1 (MQ=255) tGCTCGTGGATCAGTGAAATCCTGCTGATTTAGCGCAATGGCGATATCGCCTTCCTTGAAACCGc  <  1:1591638/65‑1 (MQ=255) tGCTCGTGGATCAGTGAAATCCTGCTGATTTAGCGCAATGGCGATATCGCCTTCCTTGAAACCGc  <  1:1588622/65‑1 (MQ=255) tGCTCGTGGATCAGTGAAATCCTGCTGATTTAGCGCAATGGCGATATCGCCTTCCTTGAAACCGc  <  1:1541775/65‑1 (MQ=255) tGCTCGTGGATCAGTGAAATCCTGCTGATTTAGCGCAATGGCGATATCGCCTTCCTTGAAACCGc  <  1:1429905/65‑1 (MQ=255) tGCTCGTGGATCAGTGAAATCCTGCTGATTTAGCGCAATGGCGATATCGCCTTCCTTGAAACCGc  <  1:1379880/65‑1 (MQ=255) tGCTCGTGGATCAGTGAAATCCTGCTGATTTAGCGCAATGGCGATATCGCCTTCCTTGAAACCGc  <  1:1320089/65‑1 (MQ=255) tGCTCGTGGATCAGTGAAATCCTGCTGATTTAGCGCAATGGCGATATCGCCTTCCTTGAAACCGc  <  1:1313956/65‑1 (MQ=255) tGCTCGTGGATCAGTGAAATCCTGCTGATTTAGCGCAATGGCGATATCGCCTTCCTTGAAACCGc  <  1:1252587/65‑1 (MQ=255) tGCTCGTGGATCAGTGAAATCCTGCTGATTTAGCGCAATGGCGATATCGCCTTCCTTGAAACCGc  <  1:1234632/65‑1 (MQ=255) tGCTCCTGGATCAGTGAAATCCTGCTGATTTAGCGCAATGGCGATATCGCCTTCCTTGAAACCGc  <  1:1413645/65‑1 (MQ=255)                                                                 | TGCTCGTGGATCAGTGAAATCCTGCTGATTTAGCGCAATGGCGATATCGCCTTCCTTGAAACCGC  >  W3110S.gb/3110845‑3110909

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑