Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3112800	3112983	184	39 [0]	[0] 58	pppA	bifunctional prepilin leader peptidase and methylase

GGCAGCGCCCTTTGAGCATCAGCCAGGAGAACAGCGGAATATTGTCACGTATCCGGATGGTCTGC  >  W3110S.gb/3112735‑3112799                                                                 | ggCAGCGCCCTTTGAGCATCAGCCAGGAGAACAGCGGAATATTGTCACGTATCCGGATGGTctgc  <  1:567118/65‑1 (MQ=255) ggCAGCGCCCTTTGAGCATCAGCCAGGAGAACAGCGGAATATTGTCACGTATCCGGATGGTctgc  <  1:1808649/65‑1 (MQ=255) ggCAGCGCCCTTTGAGCATCAGCCAGGAGAACAGCGGAATATTGTCACGTATCCGGATGGTctgc  <  1:1081845/65‑1 (MQ=255) ggCAGCGCCCTTTGAGCATCAGCCAGGAGAACAGCGGAATATTGTCACGTATCCGGATGGTctgc  <  1:187932/65‑1 (MQ=255) ggCAGCGCCCTTTGAGCATCAGCCAGGAGAACAGCGGAATATTGTCACGTATCCGGATGGTctgc  <  1:259475/65‑1 (MQ=255) ggCAGCGCCCTTTGAGCATCAGCCAGGAGAACAGCGGAATATTGTCACGTATCCGGATGGTctgc  <  1:287218/65‑1 (MQ=255) ggCAGCGCCCTTTGAGCATCAGCCAGGAGAACAGCGGAATATTGTCACGTATCCGGATGGTctgc  <  1:39100/65‑1 (MQ=255) ggCAGCGCCCTTTGAGCATCAGCCAGGAGAACAGCGGAATATTGTCACGTATCCGGATGGTctgc  <  1:399280/65‑1 (MQ=255) ggCAGCGCCCTTTGAGCATCAGCCAGGAGAACAGCGGAATATTGTCACGTATCCGGATGGTctgc  <  1:473096/65‑1 (MQ=255) ggCAGCGCCCTTTGAGCATCAGCCAGGAGAACAGCGGAATATTGTCACGTATCCGGATGGTctgc  <  1:1859279/65‑1 (MQ=255) ggCAGCGCCCTTTGAGCATCAGCCAGGAGAACAGCGGAATATTGTCACGTATCCGGATGGTctgc  <  1:61988/65‑1 (MQ=255) ggCAGCGCCCTTTGAGCATCAGCCAGGAGAACAGCGGAATATTGTCACGTATCCGGATGGTctgc  <  1:692304/65‑1 (MQ=255) ggCAGCGCCCTTTGAGCATCAGCCAGGAGAACAGCGGAATATTGTCACGTATCCGGATGGTctgc  <  1:78283/65‑1 (MQ=255) ggCAGCGCCCTTTGAGCATCAGCCAGGAGAACAGCGGAATATTGTCACGTATCCGGATGGTctgc  <  1:862892/65‑1 (MQ=255) ggCAGCGCCCTTTGAGCATCAGCCAGGAGAACAGCGGAATATTGTCACGTATCCGGATGGTctgc  <  1:916424/65‑1 (MQ=255) ggCAGCGCCCTTTGAGCATCAGCCAGGAGAACAGCGGAATATTGTCACGTATCCGGATGGTctgc  <  1:934638/65‑1 (MQ=255) ggCAGCGCCCTTTGAGCATCAGCCAGGAGAACAGCGGAATATTGTCACGTATCCGGATGGTctgc  <  1:94764/65‑1 (MQ=255) ggCAGCGCCCTTTGAGCATCAGCCAGGAGAACAGCGGAATATTGTCACGTATCCGGATGGTctgc  <  1:1438246/65‑1 (MQ=255) ggCAGCGCCCTTTGAGCATCAGCCAGGAGAACAGCGGAATATTGTCACGTATCCGGATGGTctgc  <  1:108333/65‑1 (MQ=255) ggCAGCGCCCTTTGAGCATCAGCCAGGAGAACAGCGGAATATTGTCACGTATCCGGATGGTctgc  <  1:1093692/65‑1 (MQ=255) ggCAGCGCCCTTTGAGCATCAGCCAGGAGAACAGCGGAATATTGTCACGTATCCGGATGGTctgc  <  1:127442/65‑1 (MQ=255) ggCAGCGCCCTTTGAGCATCAGCCAGGAGAACAGCGGAATATTGTCACGTATCCGGATGGTctgc  <  1:1295370/65‑1 (MQ=255) ggCAGCGCCCTTTGAGCATCAGCCAGGAGAACAGCGGAATATTGTCACGTATCCGGATGGTctgc  <  1:1340231/65‑1 (MQ=255) ggCAGCGCCCTTTGAGCATCAGCCAGGAGAACAGCGGAATATTGTCACGTATCCGGATGGTctgc  <  1:178639/65‑1 (MQ=255) ggCAGCGCCCTTTGAGCATCAGCCAGGAGAACAGCGGAATATTGTCACGTATCCGGATGGTctgc  <  1:1454781/65‑1 (MQ=255) ggCAGCGCCCTTTGAGCATCAGCCAGGAGAACAGCGGAATATTGTCACGTATCCGGATGGTctgc  <  1:1505510/65‑1 (MQ=255) ggCAGCGCCCTTTGAGCATCAGCCAGGAGAACAGCGGAATATTGTCACGTATCCGGATGGTctgc  <  1:1545809/65‑1 (MQ=255) ggCAGCGCCCTTTGAGCATCAGCCAGGAGAACAGCGGAATATTGTCACGTATCCGGAGGGTctgc  <  1:940782/65‑1 (MQ=255)  gCAGCGCCCTTTGAGCATCAGCCAGGAGAACAGCGGAATATTGTCACGTATCCGGATGGTctgc  <  1:418622/64‑1 (MQ=255)  gCAGCGCCCTTTGAGCATCAGCCAGGAGAACAGCGGAATATTGTCACGTATCCGGATGGTctgc  <  1:1554794/64‑1 (MQ=255)  gCAGCGCCCTTTGAGCATCAGCCAGGAGAACAGCGGAATATTGTCACGTATCCGGATGGTctgc  <  1:623811/64‑1 (MQ=255)  gCAGCGCCCTTTGAGCATCAGCCAGGAGAACAGCGGAATATTGTCACGTATCCGGATGGTctgc  <  1:1692464/64‑1 (MQ=255)  gCAGCGCCCTTTGAGCATCAGCCAGGAGAACAGCGGAATATTGTCACGTATCCGGATGGTctgc  <  1:1205094/64‑1 (MQ=255)  gCAGCGCCCTTTGAGCATCAGCCAGGAGAACAGCGGAATATTGTCACGTATCCGGATGGTctgc  <  1:119062/64‑1 (MQ=255)   cAGCGCCCGTTGAGCATCAGCCAGGAGAACAGCGGAATATTGTCACGTATCCGGATGGGctgc  <  1:1845622/63‑1 (MQ=255)           tttGAGCATCAGCCAGGAGAACAGCGGAATATTGTCACGTATCCGGATGGTctgc  <  1:1696371/55‑1 (MQ=255)                       ccAGGAGAACAGCGGAATATTGTCACGTATCCGGATGGTctgc  <  1:857988/43‑1 (MQ=255)                           gagaACAGCGGAATATTGTCACGTATCCGGATGGTctgc  <  1:565343/39‑1 (MQ=255)                               aCAGCGGAATATTGTCACGTATCCGGATGGTctgc  <  1:1731005/35‑1 (MQ=255)                                                                 | GGCAGCGCCCTTTGAGCATCAGCCAGGAGAACAGCGGAATATTGTCACGTATCCGGATGGTCTGC  >  W3110S.gb/3112735‑3112799

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑