Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3115078	3115137	60	23 [0]	[0] 61	yghJ	predicted inner membrane lipoprotein

TTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTAGTTGCGT  >  W3110S.gb/3115013‑3115077                                                                 | ttGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTAGTTGCGt  <  1:1599960/65‑1 (MQ=255) ttGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTAGTTGCGt  <  1:835736/65‑1 (MQ=255) ttGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTAGTTGCGt  <  1:81549/65‑1 (MQ=255) ttGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTAGTTGCGt  <  1:812005/65‑1 (MQ=255) ttGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTAGTTGCGt  <  1:738859/65‑1 (MQ=255) ttGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTAGTTGCGt  <  1:615111/65‑1 (MQ=255) ttGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTAGTTGCGt  <  1:591702/65‑1 (MQ=255) ttGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTAGTTGCGt  <  1:588845/65‑1 (MQ=255) ttGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTAGTTGCGt  <  1:551836/65‑1 (MQ=255) ttGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTAGTTGCGt  <  1:535250/65‑1 (MQ=255) ttGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTAGTTGCGt  <  1:50017/65‑1 (MQ=255) ttGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTAGTTGCGt  <  1:108138/65‑1 (MQ=255) ttGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTAGTTGCGt  <  1:1575385/65‑1 (MQ=255) ttGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTAGTTGCGt  <  1:1521990/65‑1 (MQ=255) ttGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTAGTTGCGt  <  1:1517950/65‑1 (MQ=255) ttGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTAGTTGCGt  <  1:1361707/65‑1 (MQ=255) ttGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTAGTTGCGt  <  1:1242537/65‑1 (MQ=255) ttGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTAGTTGCGt  <  1:1236777/65‑1 (MQ=255) ttGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTAGTTGCGt  <  1:1150721/65‑1 (MQ=255) ttGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTAGTTGCGt  <  1:1133027/65‑1 (MQ=255) ttGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTAGTTGCGt  <  1:1126643/65‑1 (MQ=255) ttGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCGTAGTTGCGt  <  1:1465246/65‑1 (MQ=255) ttGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCCGCGTTAAGGCTTAGTTGCGt  <  1:283389/65‑1 (MQ=255)                                                                 | TTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGGCGTTAAGGCTTAGTTGCGT  >  W3110S.gb/3115013‑3115077

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑