Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3163733	3163758	26	36 [0]	[0] 120	parC	DNA topoisomerase IV, subunit A

GATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGCAC  >  W3110S.gb/3163669‑3163732                                                                | gATCGGTGGTAGCGAATAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGcac  <  1:98370/64‑1 (MQ=255) gATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGcac  <  1:1871515/64‑1 (MQ=255) gATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGcac  <  1:193411/64‑1 (MQ=255) gATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGcac  <  1:1076829/64‑1 (MQ=255) gATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGcac  <  1:209405/64‑1 (MQ=255) gATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGcac  <  1:286991/64‑1 (MQ=255) gATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGcac  <  1:314632/64‑1 (MQ=255) gATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGcac  <  1:343653/64‑1 (MQ=255) gATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGcac  <  1:432141/64‑1 (MQ=255) gATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGcac  <  1:469220/64‑1 (MQ=255) gATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGcac  <  1:478647/64‑1 (MQ=255) gATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGcac  <  1:565320/64‑1 (MQ=255) gATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGcac  <  1:666953/64‑1 (MQ=255) gATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGcac  <  1:682157/64‑1 (MQ=255) gATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGcac  <  1:727467/64‑1 (MQ=255) gATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGcac  <  1:858843/64‑1 (MQ=255) gATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGcac  <  1:942014/64‑1 (MQ=255) gATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGcac  <  1:1555482/64‑1 (MQ=255) gATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGcac  <  1:1079862/64‑1 (MQ=255) gATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGcac  <  1:1200740/64‑1 (MQ=255) gATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGcac  <  1:1201192/64‑1 (MQ=255) gATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGcac  <  1:1268435/64‑1 (MQ=255) gATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGcac  <  1:1368311/64‑1 (MQ=255) gATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGcac  <  1:151493/64‑1 (MQ=255) gATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGcac  <  1:1520539/64‑1 (MQ=255) gATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGcac  <  1:1542936/64‑1 (MQ=255) gATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGcac  <  1:1545272/64‑1 (MQ=255) gATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGcac  <  1:1749332/64‑1 (MQ=255) gATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGcac  <  1:1627893/64‑1 (MQ=255) gATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGcac  <  1:1649952/64‑1 (MQ=255) gATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGcac  <  1:1683510/64‑1 (MQ=255) gATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGcac  <  1:1699635/64‑1 (MQ=255) gATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGcac  <  1:1713192/64‑1 (MQ=255) gATCGGTGGGAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGcac  <  1:373349/64‑1 (MQ=255)                          catcaCCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGcac  <  1:228917/39‑1 (MQ=255)                             caCCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGcac  <  1:302874/36‑1 (MQ=255)                                                                | GATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGCAC  >  W3110S.gb/3163669‑3163732

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑