Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3178873	3178915	43	37 [0]	[0] 7	ygiB	conserved outer membrane protein

GGCGGCGCGGGATTTGCACAGCAGCCGCTGTTCTCCTCGAAAAACCCAGCCAGTCCGGCTTACGG  >  W3110S.gb/3178808‑3178872                                                                 | ggcggcgCGGGATTTGCACAGCAGCCGCTGTTCTCCTCGAAAAACCCAGCCAGTCCGGCTTATgg  <  1:1644/65‑1 (MQ=255) ggcggcgCGGGATTTGCACAGCAGCCGCTGTTCTCCTCGAAAAACCCAGCCAGTCCGGCTTACgg  <  1:766261/65‑1 (MQ=255) ggcggcgCGGGATTTGCACAGCAGCCGCTGTTCTCCTCGAAAAACCCAGCCAGTCCGGCTTACgg  <  1:1792563/65‑1 (MQ=255) ggcggcgCGGGATTTGCACAGCAGCCGCTGTTCTCCTCGAAAAACCCAGCCAGTCCGGCTTACgg  <  1:1831967/65‑1 (MQ=255) ggcggcgCGGGATTTGCACAGCAGCCGCTGTTCTCCTCGAAAAACCCAGCCAGTCCGGCTTACgg  <  1:209867/65‑1 (MQ=255) ggcggcgCGGGATTTGCACAGCAGCCGCTGTTCTCCTCGAAAAACCCAGCCAGTCCGGCTTACgg  <  1:218173/65‑1 (MQ=255) ggcggcgCGGGATTTGCACAGCAGCCGCTGTTCTCCTCGAAAAACCCAGCCAGTCCGGCTTACgg  <  1:429903/65‑1 (MQ=255) ggcggcgCGGGATTTGCACAGCAGCCGCTGTTCTCCTCGAAAAACCCAGCCAGTCCGGCTTACgg  <  1:433913/65‑1 (MQ=255) ggcggcgCGGGATTTGCACAGCAGCCGCTGTTCTCCTCGAAAAACCCAGCCAGTCCGGCTTACgg  <  1:528416/65‑1 (MQ=255) ggcggcgCGGGATTTGCACAGCAGCCGCTGTTCTCCTCGAAAAACCCAGCCAGTCCGGCTTACgg  <  1:696332/65‑1 (MQ=255) ggcggcgCGGGATTTGCACAGCAGCCGCTGTTCTCCTCGAAAAACCCAGCCAGTCCGGCTTACgg  <  1:1189486/65‑1 (MQ=255) ggcggcgCGGGATTTGCACAGCAGCCGCTGTTCTCCTCGAAAAACCCAGCCAGTCCGGCTTACgg  <  1:778725/65‑1 (MQ=255) ggcggcgCGGGATTTGCACAGCAGCCGCTGTTCTCCTCGAAAAACCCAGCCAGTCCGGCTTACgg  <  1:792407/65‑1 (MQ=255) ggcggcgCGGGATTTGCACAGCAGCCGCTGTTCTCCTCGAAAAACCCAGCCAGTCCGGCTTACgg  <  1:841487/65‑1 (MQ=255) ggcggcgCGGGATTTGCACAGCAGCCGCTGTTCTCCTCGAAAAACCCAGCCAGTCCGGCTTACgg  <  1:867066/65‑1 (MQ=255) ggcggcgCGGGATTTGCACAGCAGCCGCTGTTCTCCTCGAAAAACCCAGCCAGTCCGGCTTACgg  <  1:870155/65‑1 (MQ=255) ggcggcgCGGGATTTGCACAGCAGCCGCTGTTCTCCTCGAAAAACCCAGCCAGTCCGGCTTACgg  <  1:897786/65‑1 (MQ=255) ggcggcgCGGGATTTGCACAGCAGCCGCTGTTCTCCTCGAAAAACCCAGCCAGTCCGGCTTACgg  <  1:910518/65‑1 (MQ=255) ggcggcgCGGGATTTGCACAGCAGCCGCTGTTCTCCTCGAAAAACCCAGCCAGTCCGGCTTACgg  <  1:921277/65‑1 (MQ=255) ggcggcgCGGGATTTGCACAGCAGCCGCTGTTCTCCTCGAAAAACCCAGCCAGTCCGGCTTACgg  <  1:1774530/65‑1 (MQ=255) ggcggcgCGGGATTTGCACAGCAGCCGCTGTTCTCCTCGAAAAACCCAGCCAGTCCGGCTTACgg  <  1:1175992/65‑1 (MQ=255) ggcggcgCGGGATTTGCACAGCAGCCGCTGTTCTCCTCGAAAAACCCAGCCAGTCCGGCTTACgg  <  1:1280560/65‑1 (MQ=255) ggcggcgCGGGATTTGCACAGCAGCCGCTGTTCTCCTCGAAAAACCCAGCCAGTCCGGCTTACgg  <  1:1330705/65‑1 (MQ=255) ggcggcgCGGGATTTGCACAGCAGCCGCTGTTCTCCTCGAAAAACCCAGCCAGTCCGGCTTACgg  <  1:1340440/65‑1 (MQ=255) ggcggcgCGGGATTTGCACAGCAGCCGCTGTTCTCCTCGAAAAACCCAGCCAGTCCGGCTTACgg  <  1:1359609/65‑1 (MQ=255) ggcggcgCGGGATTTGCACAGCAGCCGCTGTTCTCCTCGAAAAACCCAGCCAGTCCGGCTTACgg  <  1:1391708/65‑1 (MQ=255) ggcggcgCGGGATTTGCACAGCAGCCGCTGTTCTCCTCGAAAAACCCAGCCAGTCCGGCTTACgg  <  1:1419075/65‑1 (MQ=255) ggcggcgCGGGATTTGCACAGCAGCCGCTGTTCTCCTCGAAAAACCCAGCCAGTCCGGCTTACgg  <  1:1444975/65‑1 (MQ=255) ggcggcgCGGGATTTGCACAGCAGCCGCTGTTCTCCTCGAAAAACCCAGCCAGTCCGGCTTACgg  <  1:1456441/65‑1 (MQ=255) ggcggcgCGGGATTTGCACAGCAGCCGCTGTTCTCCTCGAAAAACCCAGCCAGTCCGGCTTACgg  <  1:1565945/65‑1 (MQ=255) ggcggcgCGGGATTTGCACAGCAGCCGCTGTTCTCCTCGAAAAACCCAGCCAGTCCGGCTTACgg  <  1:1592632/65‑1 (MQ=255) ggcggcgCGGGATTTGCACAGCAGCCGCTGTTCTCCTCGAAAAACCCAGCCAGTCCGGCTTACgg  <  1:1643672/65‑1 (MQ=255) ggcggcgCGGGATTTGCACAGCAGCCGCTGTTCTCCTCGAAAAACCCAGCCAGTCCGGCTTACgg  <  1:1685986/65‑1 (MQ=255) ggcggcgCGGGATTTGCACAGCAGCCGCTGTTCTCCTCGAAAAACCCAGCCAGTCCGGCTTACgg  <  1:1700658/65‑1 (MQ=255) ggcggcgCGGGATTTGCACAGCAGCCGCTGTTCTCCTCGAAAAACCCAGCCAGTCCGGCTTACgg  <  1:1751692/65‑1 (MQ=255) ggcggcgCGGGATTTGCACAGCAGCCGCTGTTCTCCTCGAAAAACCCAGCCAGTCCGGCTTACgg  <  1:1776548/65‑1 (MQ=255)           gATTTGCACAGCAGCCGCTGTTCTCCTCGAAAAACCCAGCCAGTCCGGCTTACgg  <  1:925748/55‑1 (MQ=255)                                                                 | GGCGGCGCGGGATTTGCACAGCAGCCGCTGTTCTCCTCGAAAAACCCAGCCAGTCCGGCTTACGG  >  W3110S.gb/3178808‑3178872

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑