Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 3187534 3187780 247 91 [0] [0] 23 yqiG predicted outer membrane usher protein

CGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAG  >  W3110S.gb/3187470‑3187533
                                                               |
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGCATCATTAAg  <  1:32320/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:370126/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:592817/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:592312/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:57856/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:573260/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:558038/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:55708/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:535838/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:531543/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:527476/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:516346/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:436623/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:608114/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:367790/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:361091/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:339944/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:334079/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:310060/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:290341/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:26887/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:24952/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:1070861/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:83509/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:97100/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:930282/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:912418/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:891996/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:875156/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:871522/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:863406/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:854750/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:851736/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:85040/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:224992/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:834110/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:82703/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:815348/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:807804/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:769326/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:768080/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:734823/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:659880/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:651110/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:642327/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:122215/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:1886396/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:1359573/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:135556/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:1354907/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:1304748/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:1300193/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:1289846/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:1250884/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:1239306/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:1238121/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:1236872/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:1362995/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:1213560/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:121052/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:1203201/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:1198286/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:1153564/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:1153415/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:1145669/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:1124860/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:1107823/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:1084251/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:1700491/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:1861044/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:1856367/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:1854744/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:1840652/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:1790458/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:1783219/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:1743372/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:1727843/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:1367136/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:1694423/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:1692237/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:1689433/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:1685790/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:1515031/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:1505420/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:1503570/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:149264/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:1402731/64‑1 (MQ=255)
cGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:137767/64‑1 (MQ=255)
 gAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:838436/63‑1 (MQ=255)
 gAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:1752654/63‑1 (MQ=255)
          gAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAg  <  1:344386/54‑1 (MQ=255)
                                                               |
CGAATTATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAG  >  W3110S.gb/3187470‑3187533

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: