Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3189076	3189143	68	16 [0]	[0] 2	yqiH	predicted periplasmic pilin chaperone

ATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTGGG  >  W3110S.gb/3189011‑3189075                                                                 | aTCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTggg  <  1:1110046/65‑1 (MQ=255) aTCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTggg  <  1:1154575/65‑1 (MQ=255) aTCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTggg  <  1:1362027/65‑1 (MQ=255) aTCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTggg  <  1:1476537/65‑1 (MQ=255) aTCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTggg  <  1:1505370/65‑1 (MQ=255) aTCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTggg  <  1:1505832/65‑1 (MQ=255) aTCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTggg  <  1:1652626/65‑1 (MQ=255) aTCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTggg  <  1:1694810/65‑1 (MQ=255) aTCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTggg  <  1:1755841/65‑1 (MQ=255) aTCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTggg  <  1:231627/65‑1 (MQ=255) aTCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTggg  <  1:45148/65‑1 (MQ=255) aTCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTggg  <  1:870492/65‑1 (MQ=255) aTCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTggg  <  1:95094/65‑1 (MQ=255)  tCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTggg  <  1:1830648/64‑1 (MQ=255)  tCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTggg  <  1:1856015/64‑1 (MQ=255)  tCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTggg  <  1:555878/64‑1 (MQ=255)                                                                 | ATCATTCGTAGAAATGACGGTTCGATCCGCTTTAACAATAAGATGCCTTATCACGTTACGCTGGG  >  W3110S.gb/3189011‑3189075

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑