Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3191855	3191859	5	97 [0]	[0] 9	yqiK	conserved hypothetical protein

GATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAT  >  W3110S.gb/3191790‑3191854                                                                 | gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAGAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:231887/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:34784/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:563498/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:545917/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:543652/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:508614/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:498990/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:493531/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:490979/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:448547/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:4195/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:396523/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:390953/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:568429/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:32302/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:314697/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:304617/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:296717/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:296715/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:28831/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:252976/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:219801/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:210114/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1021618/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:72512/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:989501/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:969414/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:938635/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:906464/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:904891/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:887867/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:877456/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:871579/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:852112/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:820298/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:7915/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:207627/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:723855/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:718244/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:701740/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:649605/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:647314/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:619105/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:608606/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:597045/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:588438/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:581189/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:577867/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1285731/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:142317/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1422957/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1396801/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1377439/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1342304/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:134178/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1341223/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1339966/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1331219/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1299027/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1297054/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1443869/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1244657/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1241042/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1211035/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1170918/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1142474/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1137480/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1114500/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1081704/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1052470/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:104095/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1031312/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1868751/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1863183/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1844855/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1822728/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1799475/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1780760/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1731378/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1657366/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1629875/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1619018/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1612948/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1602035/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1596518/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1591240/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1552590/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1517087/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1507301/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1505991/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1496598/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:147486/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1459090/65‑1 (MQ=255) gATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1866897/65‑1 (MQ=255)  aTCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:1153089/64‑1 (MQ=255)                  tGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:349388/48‑1 (MQ=255)                    tagtagTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAt  <  1:55501/46‑1 (MQ=255)                                                                 | GATCGTATGCGCGTCGATGTAGTAGTCGCTTTCTTTGTGCGGGTAAAACCTTCAGTAGAAGGGAT  >  W3110S.gb/3191790‑3191854

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑