Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3203607	3203627	21	81 [0]	[0] 47	ygiH	conserved inner membrane protein

AGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAT  >  W3110S.gb/3203544‑3203606                                                               | aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:381452/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:589115/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:56913/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:558720/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:512232/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:497879/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:454400/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:433046/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:401791/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:401757/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:601271/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:36744/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:35089/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:28344/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:271021/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:235446/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:1762688/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:1754848/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:1745307/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:1002250/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:776525/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:956633/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:944950/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:940247/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:912110/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:897281/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:866527/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:836017/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:824612/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:806105/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:1715664/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:757731/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:727531/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:723006/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:701417/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:697292/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:69728/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:65601/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:619804/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:613325/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:1151831/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:1681062/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:1295428/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:1239311/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:1233474/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:1231352/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:1198396/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:1191079/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:1158077/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:1153628/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:1323380/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:1148439/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:1125625/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:1120651/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:1080229/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:1068432/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:1054094/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:1042150/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:1034805/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:1540397/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:166637/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:1658416/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:1647714/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:159025/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:1576249/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:1555800/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:1548594/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:133021/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:1482508/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:1480414/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:1404904/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:1376316/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:1375163/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:1359904/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:1358130/63‑1 (MQ=255) aGGAATGTTGACCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:650556/63‑1 (MQ=255)                cTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:1238097/48‑1 (MQ=255)                 tGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:1606904/47‑1 (MQ=255)                      cgcgTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:1592796/42‑1 (MQ=255)                         gTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:1111377/39‑1 (MQ=255)                             gAATTAGGTGGCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAt  <  1:457919/35‑1 (MQ=255)                                                               | AGGAATGTTGCCCGTCTGGGGCGCGTATGAATTAGGTGTCAGCCCCTTCTGGCTAGGCTTAAT  >  W3110S.gb/3203544‑3203606

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑