Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 3248820 3248909 90 263 [0] [0] 64 yqjK conserved hypothetical protein

Only 100 of 263 total aligned reads displayed.

AACGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAGTCGT  >  W3110S.gb/3248755‑3248819
                                                                |
aaCGACGTAAGGCGCGACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:1707839/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:357148/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:56400/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:555045/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:549994/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:525556/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:494205/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:481915/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:438482/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:430187/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:415623/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:378182/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:360522/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:567599/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:342965/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:33399/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:319460/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:309537/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:284537/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:279322/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:272251/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:254467/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:1010474/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:227254/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:787227/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:982137/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:96255/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:951978/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:931655/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:926266/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:904663/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:896833/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:856602/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:827228/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:820585/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:798950/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:237180/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:776911/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:766053/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:754197/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:713803/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:700065/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:683323/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:649901/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:619666/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:602224/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:588734/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:574192/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:1226675/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:1455278/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:192529/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:1379280/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:1372122/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:1358246/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:1356659/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:1331961/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:1325547/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:1291883/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:124549/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:1236895/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:1400058/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:1210737/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:1165002/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:1143780/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:1124577/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:111357/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:1091764/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:1084447/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:1074408/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:1057659/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:1036504/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:102601/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:1826014/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:1800992/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:1769481/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:1735092/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:1702579/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:1669274/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:1665057/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:1636788/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:1607374/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:1581760/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:1817407/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:1548547/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:1535104/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:1513348/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:1495453/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:1850038/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:148026/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:1467404/65‑1 (MQ=255)
aaCGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAggcgt  <  1:1599632/65‑1 (MQ=255)
 acgacgTAAGGCGCAACTGCTTAGCCATATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:581539/64‑1 (MQ=255)
 acgacgTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:1504007/64‑1 (MQ=255)
 acgacgTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:1367254/64‑1 (MQ=255)
 acgacgTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:614546/64‑1 (MQ=255)
 acgacgTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:495623/64‑1 (MQ=255)
   gacgTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:1442919/62‑1 (MQ=255)
        aaGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:1486034/57‑1 (MQ=255)
              cAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:721806/51‑1 (MQ=255)
                         ccAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAgtcgt  <  1:413082/40‑1 (MQ=255)
                                                                |
AACGACGTAAGGCGCAACTGCTTAGCCAGATCCAGCAACAACGGCTGGATCTTTCCGCCAGTCGT  >  W3110S.gb/3248755‑3248819

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: